More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0583 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0583  50S ribosomal protein L3  100 
 
 		 290 aa  580  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0276  50S ribosomal protein L3  87.05 
 
 		 279 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2534  50S ribosomal protein L3  82.46 
 
 		 239 aa  400  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.129465  normal  0.91694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1716  50S ribosomal protein L3  83.26 
 
 		 240 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0849831  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0361  50S ribosomal protein L3  83.26 
 
 		 240 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0759  50S ribosomal protein L3  75.55 
 
 		 245 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496484  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0246  50S ribosomal protein L3  80.37 
 
 		 239 aa  363  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.982555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2736  ribosomal protein L3  72.07 
 
 		 251 aa  345  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.301212  normal  0.0821652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1678  50S ribosomal protein L3  68.02 
 
 		 242 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0571094  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1233  50S ribosomal protein L3  68.02 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.180117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1196  50S ribosomal protein L3  68.02 
 
 		 237 aa  322  4e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.308173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2688  50S ribosomal protein L3  65.96 
 
 		 235 aa  322  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.160659  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1795  50S ribosomal protein L3P  71.63 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.170696  normal  0.0358825 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0666  50S ribosomal protein L3  61.73 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700021  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0986  50S ribosomal protein L3  69.16 
 
 		 228 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191064  normal  0.0173239 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0698  50S ribosomal protein L3  61.73 
 
 		 246 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000853628  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1840  50S ribosomal protein L3  70.33 
 
 		 213 aa  315  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.053801  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1956  50S ribosomal protein L3  66.67 
 
 		 238 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00677731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2162  50S ribosomal protein L3  60.98 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1430  50S ribosomal protein L3  69.38 
 
 		 213 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544436  normal  0.0131541 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2440  50S ribosomal protein L3  60.98 
 
 		 246 aa  308  5e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2123  50S ribosomal protein L3  60.57 
 
 		 246 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1353  50S ribosomal protein L3  61.6 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.685053  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1332  50S ribosomal protein L3  69.38 
 
 		 213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502472  normal  0.17387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2818  50S ribosomal protein L3  60.24 
 
 		 257 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.469348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1354  50S ribosomal protein L3  63.45 
 
 		 240 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.03305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5070  50S ribosomal protein L3  62.61 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.621506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0353  50S ribosomal protein L3  60.16 
 
 		 246 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0580  50S ribosomal protein L3  60.98 
 
 		 245 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1679  50S ribosomal protein L3  63.25 
 
 		 241 aa  299  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.123125  hitchhiker  0.0000530368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1364  50S ribosomal protein L3  59.59 
 
 		 247 aa  295  6e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.803937  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1545  50S ribosomal protein L3  63.11 
 
 		 241 aa  294  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  62.83 
 
 		 251 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2218  50S ribosomal protein L3  62.61 
 
 		 241 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3184  50S ribosomal protein L3  61.41 
 
 		 241 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3448  50S ribosomal protein L3  60.41 
 
 		 243 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.925386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  62.78 
 
 		 256 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2295  50S ribosomal protein L3  62.61 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.208752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  61.71 
 
 		 251 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3667  50S ribosomal protein L3  60.53 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2966  50S ribosomal protein L3  60.62 
 
 		 227 aa  278  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0816974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1946  50S ribosomal protein L3  60.54 
 
 		 227 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  58.25 
 
 		 209 aa  234  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  58.74 
 
 		 209 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0873  ribosomal protein L3  56.25 
 
 		 212 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.339067  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  57.77 
 
 		 209 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  58.25 
 
 		 209 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  57.69 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  53.81 
 
 		 214 aa  230  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  56.25 
 
 		 214 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0612  50S ribosomal protein L3  50.69 
 
 		 231 aa  229  5e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3524  ribosomal protein L3  58.37 
 
 		 212 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0000015584  hitchhiker  0.00000758128 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  55.77 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 212 aa  223  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 212 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 212 aa  221  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02690  ribosomal large subunit assembly and maintenance-related protein, putative  49.38 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.881266  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0489  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 212 aa  219  6e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000109318  normal  0.010086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 211 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 211 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 211 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 211 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 211 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4690  50S ribosomal protein L3  54.33 
 
 		 212 aa  216  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000266431  unclonable  0.0000000247869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 211 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0184  50S ribosomal protein L3  54.07 
 
 		 212 aa  215  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000726152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 211 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4317  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 212 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000715109  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0158  50S ribosomal protein L3  55.02 
 
 		 212 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206645  decreased coverage  0.0000470561 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3758  50S ribosomal protein L3  50.97 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10617  predicted protein  52.8 
 
 		 229 aa  213  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.290577  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0426  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 212 aa  214  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000808775  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 212 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  52.91 
 
 		 209 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0409  50S ribosomal protein L3  48.39 
 
 		 231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.214097  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04308  50S ribosomal protein L3 (AFU_orthologue; AFUA_4G06000)  50.69 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569761  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0767  ribosomal protein L3  53.27 
 
 		 236 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.357159  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0059  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 		 208 aa  212  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000158228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0279  50S ribosomal protein L3  52.4 
 
 		 214 aa  212  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000003338  unclonable  0.000000102958 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0484  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 212 aa  212  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000199127  normal  0.0280354 
 
 
 
NC_009052  Sbal_4170  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200962  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  48.84 
 
 		 218 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0200  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000546138  unclonable  0.00000936811 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4056  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000139517  hitchhiker  0.00000000018898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0196  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 		 212 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  52.88 
 
 		 215 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 211 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  52.43 
 
 		 211 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3759  50S ribosomal protein L3  53.85 
 
 		 212 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000358076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  52.66 
 
 		 212 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  51.44 
 
 		 216 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0231  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 212 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2632  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.000000000488611  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3915  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 209 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.44377e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3746  50S ribosomal protein L3  53.37 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.0000000000021686  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0584  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 209 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183333  normal  0.0735815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3999  50S ribosomal protein L3  53.33 
 
 		 226 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0199  50S ribosomal protein L3  54.55 
 
 		 212 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000010724  hitchhiker  0.0000000019855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0283  50S ribosomal protein L3  53.4 
 
 		 209 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000156273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>