More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0502 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0502  ribonuclease H  100 
 
 		 157 aa  320  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2573  ribonuclease H  78.34 
 
 		 157 aa  266  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0063199  hitchhiker  0.000000590654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0182  ribonuclease H  78.95 
 
 		 157 aa  258  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0614621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3617  ribonuclease H  77.63 
 
 		 155 aa  251  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.919158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2527  ribonuclease H  76.67 
 
 		 151 aa  250  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.832874  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0154  ribonuclease H  76.67 
 
 		 151 aa  249  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0867  ribonuclease H  75.33 
 
 		 175 aa  248  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0477  ribonuclease H  68.46 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307744  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0482  ribonuclease H  68.46 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0591  ribonuclease H  66.01 
 
 		 154 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.637967  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0613  ribonuclease H  66.45 
 
 		 151 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.657296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2357  ribonuclease H  64.71 
 
 		 151 aa  208  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4028  ribonuclease H  66.67 
 
 		 150 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2687  ribonuclease H  66.44 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.319525  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1342  ribonuclease H  68 
 
 		 161 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.765967  normal  0.626609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0529  ribonuclease H  65.36 
 
 		 153 aa  204  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0653  ribonuclease H  65.13 
 
 		 151 aa  203  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0750  ribonuclease H  63.64 
 
 		 162 aa  203  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.516591  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  65.75 
 
 		 154 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4749  ribonuclease H  64.47 
 
 		 155 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4076  ribonuclease H  62.42 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3743  ribonuclease H  63.7 
 
 		 151 aa  198  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1060  ribonuclease H  61.69 
 
 		 154 aa  195  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  62.99 
 
 		 154 aa  193  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  60 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3054  ribonuclease H  64.38 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0453376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1965  ribonuclease H  64.54 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000316146  unclonable  0.00000002511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1258  ribonuclease H  62.34 
 
 		 153 aa  191  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0684  ribonuclease H  61.59 
 
 		 150 aa  190  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3357  ribonuclease H  61.97 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2217  RNase HI  61.9 
 
 		 149 aa  188  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2208  ribonuclease H  58.67 
 
 		 145 aa  186  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000168272  normal  0.227693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0719  RNase H  61.11 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0947469  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1585  ribonuclease H  62.86 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1970  ribonuclease H  60.42 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.501543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0928  ribonuclease H  61.38 
 
 		 145 aa  183  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3712  ribonuclease HI  59.09 
 
 		 150 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0350909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1763  ribonuclease H  58.06 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.890131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4427  ribonuclease H  61.15 
 
 		 147 aa  180  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000165419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1108  ribonuclease H  60.87 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0955  ribonuclease H  60 
 
 		 150 aa  180  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1054  ribonuclease H  60.87 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.52553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2683  ribonuclease H  60.87 
 
 		 154 aa  180  6e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0253331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1251  ribonuclease H  57.14 
 
 		 148 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2873  Ribonuclease H  57.14 
 
 		 148 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00808472  normal  0.318566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0868  ribonuclease H  58.5 
 
 		 148 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.243727  normal  0.451951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2066  ribonuclease H  54.67 
 
 		 150 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.043986  normal  0.0759815 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1009  Ribonuclease H  60.29 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.636789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3136  ribonuclease H  60.87 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.46528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2186  ribonuclease H  57.82 
 
 		 153 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1600  RNase H  58.62 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2790  RNase H  60.43 
 
 		 148 aa  177  4e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000215701  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2289  Ribonuclease H  58.62 
 
 		 152 aa  177  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124048  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24830  RNase HI  61.54 
 
 		 170 aa  177  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1534  ribonuclease H  59.86 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0920794  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2815  ribonuclease H  55.48 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1992  ribonuclease H  59.86 
 
 		 146 aa  177  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0911  ribonuclease H  61.03 
 
 		 155 aa  177  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2035  ribonuclease H  58.45 
 
 		 147 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  63.77 
 
 		 163 aa  177  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0596  ribonuclease HI  60.43 
 
 		 148 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0763  ribonuclease HI  60.43 
 
 		 148 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1496  RNase H  60.43 
 
 		 148 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1466  RNase H  60.43 
 
 		 148 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0556  RNase H  60.43 
 
 		 148 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1273  ribonuclease HI  60.43 
 
 		 148 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.244888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41060  ribonuclease H  58.9 
 
 		 148 aa  176  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0500  ribonuclease H  55.7 
 
 		 153 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.478203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1174  ribonuclease H  58.99 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00138258  normal  0.132038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3481  ribonuclease H  58.22 
 
 		 148 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1162  ribonuclease H  58.99 
 
 		 147 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02389  ribonuclease H  59.56 
 
 		 156 aa  175  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.197834  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1143  ribonuclease H  60.14 
 
 		 154 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.775724  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0804  ribonuclease H  58.27 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29600  ribonuclease H  58.44 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.891548  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1285  ribonuclease H  58.27 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00259503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1256  ribonuclease H  58.27 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262659  normal  0.25341 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  54.25 
 
 		 164 aa  174  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2189  ribonuclease H  54.67 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0748  ribonuclease H  58.33 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.533393  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1134  ribonuclease H  60.14 
 
 		 150 aa  174  4e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.326698  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4573  Ribonuclease H  59.29 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0219  ribonuclease H  55.56 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00237232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00207  ribonuclease H  55.56 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.851229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3394  Ribonuclease H  55.56 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.770336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0227  ribonuclease H  55.56 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0209104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3451  ribonuclease H  55.56 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.453001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0219  ribonuclease H  55.56 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523494  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  57.14 
 
 		 148 aa  174  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0209  ribonuclease H  55.56 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2112  ribonuclease H  53.46 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0006502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1745  ribonuclease H  57.14 
 
 		 148 aa  174  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.134383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00212  hypothetical protein  55.56 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0225  ribonuclease H  55.56 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.367892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2403  ribonuclease H  55.63 
 
 		 185 aa  173  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000280033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2435  Ribonuclease H  58.45 
 
 		 235 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000684172  hitchhiker  0.00771463 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0833  bifunctional ribonuclease HI/DNA polymerase III, epsilon subunit  60.28 
 
 		 527 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.13569 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0855  DNA polymerase III, epsilon subunit  59.57 
 
 		 532 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3467  ribonuclease H  58.22 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0409  ribonuclease H  55.24 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>