42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0477 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  69.23 
 
 
300 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  67.83 
 
 
300 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  67.83 
 
 
300 aa  332  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  61.77 
 
 
297 aa  325  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  63.29 
 
 
297 aa  291  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  59.79 
 
 
309 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  37.68 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  32.99 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  32.07 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  36.74 
 
 
333 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  34.98 
 
 
323 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  31.53 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  32.89 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  34.42 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  32.99 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  33.65 
 
 
327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  35.05 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  35.68 
 
 
323 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  37.09 
 
 
316 aa  109  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  31.16 
 
 
349 aa  109  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  35.71 
 
 
298 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  31.75 
 
 
319 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  35.21 
 
 
323 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  34.27 
 
 
326 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  34.27 
 
 
326 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  33.33 
 
 
329 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  31.44 
 
 
337 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  31.89 
 
 
297 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  32.02 
 
 
337 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  26.64 
 
 
333 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  26.64 
 
 
333 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  32 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  26.55 
 
 
347 aa  96.3  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  31.34 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  34.03 
 
 
311 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  34.12 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  33.61 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  31.58 
 
 
301 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0427  cell division protein, putative  25.53 
 
 
295 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>