More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0417 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  91.23 
 
 		 228 aa  434  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  92.11 
 
 		 228 aa  434  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2505  two component transcriptional regulator  90.35 
 
 		 228 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.472327  normal  0.764107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0847  two component transcriptional regulator  90.35 
 
 		 228 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.140263  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3128  two component transcriptional regulator  89.04 
 
 		 228 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.780725  hitchhiker  0.000183133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2374  two component transcriptional regulator  86.84 
 
 		 228 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1289  two component transcriptional regulator  70.93 
 
 		 240 aa  336  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101499  normal  0.741023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  69.03 
 
 		 256 aa  328  5.0000000000000004e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  67.71 
 
 		 227 aa  325  3e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  67.26 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  67.26 
 
 		 227 aa  323  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  66.08 
 
 		 228 aa  321  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1771  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 		 228 aa  319  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.046286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  65.64 
 
 		 228 aa  318  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4227  two component response regulator  68.61 
 
 		 227 aa  318  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0109817  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  65.64 
 
 		 228 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.64 
 
 		 228 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3763  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.26 
 
 		 227 aa  315  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3056  two component transcriptional regulator  68.16 
 
 		 253 aa  314  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0280  two component transcriptional regulator  64.76 
 
 		 228 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.123527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4088  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.37 
 
 		 227 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3424  two component transcriptional regulator  66.37 
 
 		 227 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.56 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  63.88 
 
 		 228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 228 aa  298  5e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5036  two component transcriptional regulator  67.7 
 
 		 232 aa  298  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.23 
 
 		 228 aa  294  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4105  two component transcriptional regulator  62.11 
 
 		 228 aa  291  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0177  two component transcriptional regulator  65.64 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0094  two component transcriptional regulator  65.2 
 
 		 228 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402679  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1576  response regulator receiver  59.47 
 
 		 235 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.630975  normal  0.0547836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1855  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.47 
 
 		 228 aa  280  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.848692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1663  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.47 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.489331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2814  two component transcriptional regulator  58.95 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.164674  normal  0.0215513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0059  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 228 aa  245  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3638  two component transcriptional regulator  48.26 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  41.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  41.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  41.48 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 229 aa  152  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  40.61 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.35 
 
 		 231 aa  149  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  38.53 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  39.65 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.63 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0673  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.996485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.53 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.93 
 
 		 242 aa  144  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  40.81 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  36.28 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.29 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  40.44 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 230 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 226 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 224 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 247 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.77 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.79 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.87 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3780  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>