78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0353 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  100 
 
 		 530 aa  1071    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  48.23 
 
 		 526 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  38.73 
 
 		 477 aa  195  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  46.81 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  43.5 
 
 		 833 aa  164  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  47.62 
 
 		 354 aa  163  7e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  41.58 
 
 		 589 aa  153  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  43.87 
 
 		 561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  41.12 
 
 		 369 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  44.15 
 
 		 425 aa  146  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  42.49 
 
 		 353 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  39.79 
 
 		 351 aa  143  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  43.65 
 
 		 319 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0807  hypothetical protein  38.35 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  41.4 
 
 		 322 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  38.89 
 
 		 220 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  36.68 
 
 		 792 aa  130  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  38.07 
 
 		 1462 aa  127  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  39.66 
 
 		 207 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  37.63 
 
 		 207 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  37.93 
 
 		 232 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  32.44 
 
 		 387 aa  124  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  35.27 
 
 		 398 aa  119  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.75 
 
 		 950 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  36.32 
 
 		 364 aa  117  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  38.69 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 		 1043 aa  111  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4344  hypothetical protein  35.59 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0548812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1488  hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 		 854 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  34.58 
 
 		 767 aa  107  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  33.33 
 
 		 438 aa  103  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  41.13 
 
 		 332 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  38.56 
 
 		 352 aa  98.2  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  36.91 
 
 		 1050 aa  90.1  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1503 aa  89.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  32.21 
 
 		 340 aa  87  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  35.23 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  33.15 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  38.82 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  33.16 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  34.23 
 
 		 594 aa  79.7  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  34.9 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  34.01 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  33.33 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  35.85 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  34.21 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  38.67 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  36.05 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  34.36 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  34.78 
 
 		 343 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  29.74 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  35.37 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  32.43 
 
 		 743 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  34.9 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  29.9 
 
 		 738 aa  71.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  31.08 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0352  hypothetical protein  30.99 
 
 		 348 aa  69.7  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0616  hypothetical protein  25.99 
 
 		 255 aa  69.7  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  34.72 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0857  hypothetical protein  32.17 
 
 		 1280 aa  61.6  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  32.89 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  28.67 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  31.08 
 
 		 848 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  28.67 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  28.38 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  28.38 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2968  hypothetical protein  28.49 
 
 		 197 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2997  hypothetical protein  28.38 
 
 		 365 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1563  hypothetical protein  33.66 
 
 		 230 aa  51.2  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.170983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00661  hypothetical protein  34.23 
 
 		 1083 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.464249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1518  hypothetical protein  31.82 
 
 		 202 aa  50.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.785989  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  37.86 
 
 		 2027 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  24.08 
 
 		 774 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1025  hypothetical protein  37.11 
 
 		 182 aa  49.3  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  44.93 
 
 		 190 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  27.67 
 
 		 766 aa  47.4  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  25 
 
 		 644 aa  45.1  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  26.83 
 
 		 1030 aa  43.9  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>