More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0319 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  77.11 
 
 
425 aa  666    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  79.76 
 
 
416 aa  682    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  78.8 
 
 
425 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
419 aa  867    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  81.29 
 
 
421 aa  696    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  79.04 
 
 
425 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  76.56 
 
 
420 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  65.15 
 
 
420 aa  531  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  62.86 
 
 
427 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  63.77 
 
 
427 aa  530  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  63.77 
 
 
427 aa  530  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3390  MiaB-like tRNA modifying enzyme  64.2 
 
 
426 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  62.68 
 
 
444 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  60.05 
 
 
449 aa  509  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  60.91 
 
 
422 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0515  MiaB-like tRNA modifying enzyme  61.3 
 
 
443 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.481565  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  61.24 
 
 
423 aa  491  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme  60.19 
 
 
424 aa  485  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.852601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  59.06 
 
 
441 aa  486  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  63.16 
 
 
423 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  55.93 
 
 
427 aa  486  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4070  MiaB-like tRNA modifying enzyme  60.54 
 
 
424 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  58.07 
 
 
420 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3747  MiaB-like tRNA modifying enzyme  59.07 
 
 
424 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4197  hypothetical protein  58.78 
 
 
424 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2775  2-methylthioadenine synthetase  59.86 
 
 
422 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.254506  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0373  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  60.1 
 
 
434 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215959  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  57.46 
 
 
411 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.15 
 
 
435 aa  428  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  53.23 
 
 
420 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.35 
 
 
437 aa  427  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.18 
 
 
410 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0184  MiaB-like tRNA modifying enzyme  56.66 
 
 
412 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2721  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.96 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2948  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.37 
 
 
410 aa  414  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  hitchhiker  0.001764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.43 
 
 
433 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.21 
 
 
408 aa  396  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5336  MiaB-like tRNA modifying enzyme  55.34 
 
 
408 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2929  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.81 
 
 
419 aa  394  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.301495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3655  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.9 
 
 
423 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0378988  normal  0.0160657 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0217  MiaB family tRNA modification protein  46.17 
 
 
412 aa  375  1e-103  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  45.9 
 
 
411 aa  365  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0785  MiaB family tRNA modification protein  43.58 
 
 
429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1401  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.41 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.14892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2731  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.18 
 
 
441 aa  276  7e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.549128  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.56 
 
 
432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  38.37 
 
 
440 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  37.39 
 
 
451 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.75 
 
 
438 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.12 
 
 
431 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  36.64 
 
 
449 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  36.21 
 
 
436 aa  259  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.98 
 
 
467 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.22 
 
 
449 aa  256  4e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.5 
 
 
450 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.01 
 
 
438 aa  251  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.15 
 
 
434 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  36.01 
 
 
450 aa  249  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.65 
 
 
429 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.69 
 
 
471 aa  245  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  33.42 
 
 
434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  35.29 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  35.29 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  35.55 
 
 
450 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  35.32 
 
 
450 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  35.55 
 
 
450 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  35.55 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  35.55 
 
 
450 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.08 
 
 
444 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  35.32 
 
 
450 aa  243  6e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  35.55 
 
 
450 aa  242  9e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  35.05 
 
 
431 aa  242  9e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  35.55 
 
 
450 aa  242  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  39.44 
 
 
450 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  39.44 
 
 
450 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  35.07 
 
 
435 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.73 
 
 
429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  35.89 
 
 
446 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.99 
 
 
427 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  35.19 
 
 
448 aa  239  5e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.06 
 
 
450 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.41 
 
 
435 aa  239  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  37.34 
 
 
437 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.73 
 
 
430 aa  235  9e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.76 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  34.84 
 
 
441 aa  233  3e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.09 
 
 
434 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  33.08 
 
 
434 aa  233  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.35 
 
 
466 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.55 
 
 
434 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.55 
 
 
434 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 
429 aa  229  9e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.91 
 
 
439 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.23 
 
 
417 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.15 
 
 
495 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.92 
 
 
425 aa  227  3e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  34.64 
 
 
454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.53 
 
 
441 aa  226  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.54 
 
 
442 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.33 
 
 
444 aa  222  9e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>