More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0201 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0201  methyltransferase GidB  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2889  methyltransferase GidB  49.49 
 
 
206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1228  putative GidB, glucose inhibited division protein  49.49 
 
 
206 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2665  methyltransferase GidB  47.12 
 
 
208 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102332  normal  0.865597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2866  methyltransferase GidB  43.84 
 
 
205 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0426802  normal  0.092936 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1275  methyltransferase GidB  45.13 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1027  methyltransferase GidB  45.55 
 
 
212 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.707991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1835  16S rRNA methyltransferase GidB  43.48 
 
 
245 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0884797  normal  0.317572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1584  methyltransferase GidB  45.69 
 
 
211 aa  149  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.047924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1863  methyltransferase GidB  45.79 
 
 
211 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0828096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1655  methyltransferase GidB  44.21 
 
 
211 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  0.36216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1409  methyltransferase GidB  46.6 
 
 
212 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.302587  normal  0.126108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4092  methyltransferase GidB  43.46 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.295538  normal  0.0121134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3203  16S rRNA methyltransferase GidB  43.15 
 
 
213 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0005  methyltransferase GidB  43.23 
 
 
193 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3456  methyltransferase GidB  39.66 
 
 
195 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1286  methyltransferase GidB  44.33 
 
 
221 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0860  16S rRNA methyltransferase GidB  41.8 
 
 
213 aa  138  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3929  16S rRNA methyltransferase GidB  41.67 
 
 
205 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0431  16S rRNA methyltransferase GidB  44.85 
 
 
233 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2847  methyltransferase GidB  39.72 
 
 
217 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.165278 
 
 
-
 
NC_004310  BR2060  16S rRNA methyltransferase GidB  42.86 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.774916  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0012  16S rRNA methyltransferase GidB  38.95 
 
 
215 aa  134  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.017889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0390  16S rRNA methyltransferase GidB  43.81 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1980  16S rRNA methyltransferase GidB  42.33 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4387  16S rRNA methyltransferase GidB  40.31 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4255  16S rRNA methyltransferase GidB  41.15 
 
 
205 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.412528  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3626  glucose inhibited division protein  40.41 
 
 
201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2589  methyltransferase GidB  40.31 
 
 
219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.103455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1938  methyltransferase GidB  41.76 
 
 
209 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.599081  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3470  16S rRNA methyltransferase GidB  42.86 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0166  16S rRNA methyltransferase GidB  42.93 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.851437  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0289  16S rRNA methyltransferase GidB  40.41 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.919787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0295  16S rRNA methyltransferase GidB  43.32 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408188  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2962  methyltransferase GidB  39.68 
 
 
207 aa  121  7e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0104  16S rRNA methyltransferase GidB  40.62 
 
 
260 aa  119  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0096  16S rRNA methyltransferase GidB  39.58 
 
 
277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5025  methyltransferase GidB  34.43 
 
 
221 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.692099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0135  methyltransferase GidB  37.98 
 
 
230 aa  116  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2855  methyltransferase GidB  39.9 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2405  methyltransferase GidB  41.24 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.897894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0001  methyltransferase GidB  35.37 
 
 
209 aa  88.6  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0073145  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  32.4 
 
 
214 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  32.77 
 
 
218 aa  84.7  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
216 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  34.92 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2553  methyltransferase GidB  35.06 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000314957  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  32.78 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  32.78 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3754  methyltransferase GidB  31.55 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0139272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  31.46 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  35.54 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  34.39 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  34.57 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0180  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
236 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235371  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0807  16S rRNA methyltransferase GidB  25 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  33.33 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0051  16S rRNA methyltransferase GidB  32.22 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4980  methyltransferase GidB  36.13 
 
 
210 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6482  methyltransferase GidB  35.39 
 
 
213 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0936076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3112  16S rRNA methyltransferase GidB  36.36 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  32.95 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0205  16S rRNA methyltransferase GidB  30.85 
 
 
240 aa  78.2  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  30.53 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4146  methyltransferase GidB  28.92 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31930  glucose-inhibited division protein B  27.64 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  30.29 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  29.89 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4056  methyltransferase GidB  27.93 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4588  16S rRNA methyltransferase GidB  37.43 
 
 
242 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.188204  hitchhiker  0.000465387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  29.71 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  31.45 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_38010  glucose-inhibited division protein B  32.58 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  31.28 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  31.05 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  29.76 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  31.05 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26990  glucose-inhibited division protein B  32.34 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  32.39 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  27.42 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1127  glucose inhibited division protein B  27.27 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  30.77 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5091  methyltransferase GidB  33.12 
 
 
223 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  31.36 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  32.42 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1441  16S rRNA methyltransferase GidB  31.21 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0376  methyltransferase GidB  34.39 
 
 
189 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.326616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3294  methyltransferase GidB  30.92 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4508  methyltransferase GidB  33.73 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  30.99 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2156  methyltransferase GidB  37.59 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  29.19 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39750  glucose-inhibited division protein B  34.9 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201257  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7094  methyltransferase GidB  30.13 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5410  methyltransferase GidB  33.33 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0833  16S rRNA methyltransferase GidB  30.13 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2363  methyltransferase GidB  28.75 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.720797  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0352  16S rRNA methyltransferase GidB  31.94 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.201339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6073  16S rRNA methyltransferase GidB  26.67 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.22977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>