More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0118 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
339 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  70.57 
 
 
336 aa  493  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2021  putative binding protein component of ABC iron transporter  67.68 
 
 
342 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  48.8 
 
 
337 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  49.39 
 
 
341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  46 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  48.33 
 
 
337 aa  316  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  49.53 
 
 
337 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  49.07 
 
 
350 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  49.07 
 
 
350 aa  312  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  48.1 
 
 
341 aa  306  4.0000000000000004e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  45.6 
 
 
365 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  45.6 
 
 
365 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  47.08 
 
 
351 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  47.84 
 
 
347 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  44.84 
 
 
347 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 
348 aa  289  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  45.78 
 
 
347 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  44.31 
 
 
348 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  43.64 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  43.6 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  45.97 
 
 
340 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  42.98 
 
 
351 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  43.83 
 
 
353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  44.51 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  44.21 
 
 
347 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  43.23 
 
 
366 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  41.88 
 
 
372 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  41.32 
 
 
355 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  43.3 
 
 
345 aa  264  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 
355 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  44.83 
 
 
345 aa  259  7e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.5 
 
 
334 aa  256  5e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  39.53 
 
 
347 aa  255  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  40.87 
 
 
353 aa  252  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.05 
 
 
334 aa  252  6e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.05 
 
 
334 aa  252  6e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  39.88 
 
 
334 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  38.02 
 
 
346 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 
351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  38.04 
 
 
335 aa  241  9e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  39.77 
 
 
338 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
347 aa  237  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 
337 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  39.88 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  37.1 
 
 
341 aa  235  7e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  40.96 
 
 
336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  38.01 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  37.72 
 
 
338 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  38.32 
 
 
349 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  38.7 
 
 
335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  41.16 
 
 
336 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  37.81 
 
 
338 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  37.87 
 
 
338 aa  231  2e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  38.32 
 
 
336 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  38.17 
 
 
338 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  41.16 
 
 
336 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  38.29 
 
 
346 aa  229  6e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  36.22 
 
 
374 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  41.14 
 
 
337 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  35.62 
 
 
337 aa  223  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  39.87 
 
 
335 aa  222  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  35.76 
 
 
337 aa  222  7e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0440  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  38.61 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.576038  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  35.91 
 
 
374 aa  220  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  34.59 
 
 
337 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  35.59 
 
 
339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  37.77 
 
 
362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  34.13 
 
 
336 aa  216  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  35.03 
 
 
335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  36.73 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 
372 aa  215  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  35.99 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  37.36 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  34.51 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 
347 aa  212  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  39.18 
 
 
351 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  39.18 
 
 
351 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.87 
 
 
351 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  38.87 
 
 
351 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.87 
 
 
351 aa  210  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  36.44 
 
 
341 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  38.87 
 
 
351 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 
347 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  38.87 
 
 
351 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  36.76 
 
 
347 aa  209  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 
335 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  36.55 
 
 
341 aa  209  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  36.65 
 
 
347 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  34.72 
 
 
332 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  37.93 
 
 
347 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  32.07 
 
 
341 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  34.86 
 
 
348 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  35.31 
 
 
342 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  34.69 
 
 
337 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
342 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  32.07 
 
 
341 aa  206  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>