More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0097 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 218 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5058  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 195 aa  98.2  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 193 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  42.73 
 
 		 194 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0904  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 211 aa  88.2  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0824382  normal  0.0227277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 204 aa  84.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2779  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  84.3  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0446  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1774  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2892  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2386  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0385  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.464521 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
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NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4501  putative transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0534  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5182  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000128547  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3140  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  32.35 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5134  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5717  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009484  Acry_3101  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
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NC_010338  Caul_4047  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.866362  normal  0.450827 
 
 
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NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
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NC_007802  Jann_2619  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.362845  normal  0.246457 
 
 
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NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_7235  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6901  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3927  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.375374  normal  0.0268365 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1626  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009719  Plav_0716  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_1681  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4144  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188303  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4571  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2156  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000133556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1327  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128792 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1289  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  38.21 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000673566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01107  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.16 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B1972  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.134426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2490  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000804693 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  32.16 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2212  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2015  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1089  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1234  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1233  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0636137  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
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NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
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NC_008048  Sala_2692  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.504761 
 
 
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NC_008228  Patl_0208  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.41994  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3672  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.6904  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
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NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_5542  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789571  normal  0.111085 
 
 
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NC_009667  Oant_2227  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_5345  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.922777  normal  0.179588 
 
 
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NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  72  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1179  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.288888  normal  0.322158 
 
 
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NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 182 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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