More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0092 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0092  two component transcriptional regulator  100 
 
 
239 aa  481  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  74.46 
 
 
232 aa  334  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  74.46 
 
 
232 aa  334  5.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  74.46 
 
 
232 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3299  DNA-binding response regulator PetR  74.79 
 
 
237 aa  325  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  70.04 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2600  two component transcriptional regulator  64.96 
 
 
239 aa  295  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2269  two component transcriptional regulator  56.41 
 
 
243 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1386  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 
241 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645659  normal  0.474436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2518  two-component transcriptional regulator  52.59 
 
 
246 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2245  two component transcriptional regulator  51.71 
 
 
233 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.398974  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3884  winged helix family two component transcriptional regulator  53.02 
 
 
241 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3137  two component transcriptional regulator  53.45 
 
 
242 aa  224  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2558  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 
239 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1737  two component transcriptional regulator  51.52 
 
 
243 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.151372  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 
233 aa  221  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4173  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 
241 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2748  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.28 
 
 
233 aa  221  9e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4852  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.72 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  52.36 
 
 
231 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0989  DNA-binding response regulator  47.84 
 
 
234 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.016967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  50.21 
 
 
240 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 
246 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1521  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  50.86 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.675435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1472  putative transcriptional regulatory protein OmpR  50.86 
 
 
241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.830233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1644  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 
235 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3164  two component response regulator  49.16 
 
 
232 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0516901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  53.25 
 
 
233 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4351  two component transcriptional regulator  52.94 
 
 
233 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3546  two component transcriptional regulator  49.36 
 
 
273 aa  202  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  0.686762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.22 
 
 
244 aa  197  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2511  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 
244 aa  197  9e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  46.38 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  46.38 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  43.67 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  46.38 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  46.38 
 
 
241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3846  osmolarity response regulator  45.53 
 
 
241 aa  195  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  44.54 
 
 
241 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  194  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03257  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0308  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  44.96 
 
 
241 aa  193  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3700  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03209  hypothetical protein  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3784  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0308  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0516186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0244  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2808  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.11 
 
 
242 aa  193  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3871  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3703  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3775  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3818  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.339561  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4711  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3879  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0324  osmolarity response regulator  43.57 
 
 
239 aa  193  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3602  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3686  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.550003 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4621  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3809  osmolarity response regulator  43.98 
 
 
239 aa  193  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  45.69 
 
 
254 aa  192  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3980  osmolarity response regulator  43.57 
 
 
239 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.75818  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4206  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3898  osmolarity response regulator  43.57 
 
 
239 aa  192  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4338  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2585  response regulator receiver  45.11 
 
 
242 aa  192  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  45.69 
 
 
254 aa  192  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4075  osmolarity response regulator  43.57 
 
 
239 aa  192  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4134  osmolarity response regulator  45.11 
 
 
241 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  44.54 
 
 
241 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0172  osmolarity response regulator  43.57 
 
 
239 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3741  osmolarity response regulator  43.57 
 
 
239 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0204  osmolarity response regulator  43.28 
 
 
239 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2286  osmolarity response regulator  43.78 
 
 
240 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  45.96 
 
 
243 aa  191  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  43.83 
 
 
240 aa  191  8e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  44.54 
 
 
240 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2613  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 
242 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  44.86 
 
 
243 aa  190  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  46.15 
 
 
243 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  44.54 
 
 
241 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  46.15 
 
 
243 aa  190  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001870  two-component system response regulator OmpR  43.28 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.360284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00621  osmolarity response regulator  43.28 
 
 
239 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  44.44 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  43.83 
 
 
240 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  45.15 
 
 
245 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  44.87 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  45.92 
 
 
240 aa  188  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  45.3 
 
 
243 aa  188  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2732  osmolarity response regulator  45.73 
 
 
243 aa  187  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.744063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  46.15 
 
 
243 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  45.15 
 
 
245 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4069  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
235 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473392  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1574  osmolarity response regulator  45.58 
 
 
236 aa  185  5e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  43.15 
 
 
245 aa  185  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  44.3 
 
 
245 aa  184  9e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  41.81 
 
 
257 aa  182  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  42.8 
 
 
246 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>