More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0050 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
210 aa  427  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 
207 aa  194  7e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 
207 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
207 aa  191  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  48.47 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  42.72 
 
 
207 aa  176  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
218 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 
225 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
208 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
209 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 
215 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
220 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 
208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
221 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
208 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  33.33 
 
 
209 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
211 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
213 aa  106  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  34.74 
 
 
220 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 
217 aa  104  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 
220 aa  104  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
226 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 
211 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
228 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
210 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 
220 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
231 aa  101  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.14 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  30.05 
 
 
251 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
213 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.73 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
259 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
213 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
211 aa  92.8  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 
209 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 
224 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
214 aa  89  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  30.77 
 
 
201 aa  88.2  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
207 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
207 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 
226 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
206 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
202 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 
226 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  29.47 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1358  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 
202 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
247 aa  85.5  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 
247 aa  85.5  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
206 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 
237 aa  85.1  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  29.41 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
211 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
228 aa  82  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  31.07 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 
223 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
198 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  28.1 
 
 
205 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  32.28 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
192 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.186395 
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.669667 
 
 
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NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.554096 
 
 
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