More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0031 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  100 
 
 		 158 aa  323  8.000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  81.29 
 
 		 160 aa  263  8e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  78.48 
 
 		 158 aa  261  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  78.85 
 
 		 156 aa  253  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  75.8 
 
 		 157 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  75.8 
 
 		 157 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  74.03 
 
 		 157 aa  222  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  56.96 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  56.96 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  55.06 
 
 		 158 aa  194  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  57.59 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  55.7 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  58.78 
 
 		 157 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  55.7 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  53.8 
 
 		 155 aa  183  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 159 aa  183  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 157 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  57.43 
 
 		 157 aa  180  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  57.93 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  56.76 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  51.9 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  50.96 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  53.8 
 
 		 165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  53.38 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  54.42 
 
 		 160 aa  170  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  53.33 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  58.11 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  50.97 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  53.42 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  50.63 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  50.63 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  48.73 
 
 		 157 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  48.73 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  48.73 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  49.37 
 
 		 157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  45.51 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  48.08 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  49.32 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  45.57 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  44.37 
 
 		 147 aa  137  3.9999999999999997e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  43.42 
 
 		 153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  43.24 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  42.86 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  40.65 
 
 		 161 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  43.04 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  44.6 
 
 		 150 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  46.67 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  45.03 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  45.33 
 
 		 155 aa  134  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  45.95 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  46.04 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0822  SsrA-binding protein  43.87 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0962  SsrA-binding protein  44.94 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  44.59 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0806  SsrA-binding protein  43.87 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  45.16 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1318  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.183841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  43.15 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  45.07 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  43.59 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2479  SsrA-binding protein  46.88 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0209136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1485  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  45.77 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1393  SsrA-binding protein  42.11 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00517715  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0815  SsrA-binding protein  44.52 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1901  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 148 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.673502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  43.51 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1702  SsrA-binding protein  45.58 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  45.21 
 
 		 151 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  46.58 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  45.03 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  43.33 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1455  SsrA-binding protein  42.11 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000318181  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  47.14 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  41.78 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2627  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2412  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3280  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.234096  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2467  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.838466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1532  SsrA-binding protein  46.53 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184904  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0374  SsrA-binding protein  46.84 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01177  SsrA-binding protein  42.07 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  42.68 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1807  SsrA-binding protein  44.23 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>