30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0006 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  266  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.582678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  38.73 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  35 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2604  Curlin associated repeat protein  35.16 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01045  hypothetical protein  35.16 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2558  curlin minor subunit  35.16 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1160  curlin minor subunit  35.16 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.48235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01038  curlin nucleator protein, minor subunit in curli complex  35.16 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1421  curlin minor subunit  35.16 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.256433 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1161  curlin minor subunit  35.16 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.627916  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0926  hypothetical protein  34.4 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0402571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2090  curlin minor subunit  35.16 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1254  curlin minor subunit  34.07 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2230  curlin minor subunit  34.07 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2047  curlin minor subunit  34.07 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1209  curlin minor subunit  34.07 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.524993  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1239  curlin minor subunit  34.07 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.486052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1816  curlin-associated protein  28.39 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  36.7 
 
 		 552 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  35.56 
 
 		 453 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1557  curlin minor subunit  35.16 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.350896  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3599  hypothetical protein  32.06 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2365  curlin-associated protein  29.41 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1725  curlin-associated protein  37.37 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0532195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  33.11 
 
 		 500 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  32.56 
 
 		 503 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3398  curlin associated repeat protein  29.41 
 
 		 157 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170694  normal  0.798817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1997  curlin associated  28.43 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.465016  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  30.71 
 
 		 498 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  28.43 
 
 		 156 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>