205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_2079 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_2079  50S ribosomal protein L23  100 
 
 
93 aa  189  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000138255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1702  50S ribosomal protein L23  98.92 
 
 
93 aa  187  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000496686  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1873  50S ribosomal protein L23  96.77 
 
 
93 aa  185  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0703084  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0061  50S ribosomal protein L23  87.1 
 
 
93 aa  167  3e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000483414  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0036  50S ribosomal protein L23  84.95 
 
 
93 aa  164  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00020756  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0086  50S ribosomal protein L23  84.95 
 
 
93 aa  160  6e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00130927  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1030  50S ribosomal protein L23  82.8 
 
 
93 aa  157  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000430849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0353  50S ribosomal protein L23  80.65 
 
 
93 aa  156  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000019966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1966  50S ribosomal protein L23  74.19 
 
 
93 aa  140  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0288  50S ribosomal protein L23  65.56 
 
 
93 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00767163  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  42.17 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  42.17 
 
 
98 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  44.3 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  44.3 
 
 
98 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  40.96 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  40.45 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 
98 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 
98 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  41.77 
 
 
97 aa  61.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  39.74 
 
 
100 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  32.18 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  43.04 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  38.55 
 
 
98 aa  58.9  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  37.97 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  40.26 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  40.26 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  40.26 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000460172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  41.33 
 
 
98 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310283  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  37.66 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  40 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  35.44 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  35.14 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  38.64 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  38.67 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  35.87 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  37.66 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  37.33 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  37.33 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  36.47 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  38.96 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  37.33 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  35.44 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  36.25 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  38.2 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  36.9 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  37.18 
 
 
100 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  38.67 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  33.33 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  40.91 
 
 
97 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  36 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  36.59 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  38.67 
 
 
99 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  36.59 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  36.49 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  37.33 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  35.71 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>