More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1998 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1810  DNA primase  97.36 
 
 
605 aa  1170    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1629  DNA primase  97.52 
 
 
614 aa  1172    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.332155  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1998  DNA primase  100 
 
 
605 aa  1225    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1497  DNA primase  59.33 
 
 
595 aa  647    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1745  DNA primase  55.67 
 
 
546 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2069  DNA primase  46.5 
 
 
554 aa  458  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1610  DNA primase  47.66 
 
 
548 aa  412  1e-114  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0795  DNA primase  50.12 
 
 
572 aa  415  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1978  DNA primase  41.61 
 
 
552 aa  381  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  35.18 
 
 
550 aa  325  1e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  33.4 
 
 
539 aa  270  8e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  29.04 
 
 
582 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  28.67 
 
 
583 aa  250  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  31.38 
 
 
587 aa  249  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  36.66 
 
 
564 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  31.52 
 
 
604 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.16 
 
 
598 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  30.97 
 
 
578 aa  243  6e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  28.08 
 
 
588 aa  242  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.09 
 
 
595 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  29.44 
 
 
587 aa  241  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.85 
 
 
601 aa  241  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  30.43 
 
 
588 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  33.97 
 
 
559 aa  236  7e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  32.13 
 
 
560 aa  234  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  33.08 
 
 
591 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  30.96 
 
 
587 aa  233  7.000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.53 
 
 
617 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  28.4 
 
 
587 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  32.67 
 
 
544 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  31.36 
 
 
581 aa  231  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  35.06 
 
 
596 aa  230  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  29.08 
 
 
594 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  34.35 
 
 
576 aa  228  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  31.12 
 
 
577 aa  226  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  39.1 
 
 
577 aa  227  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  33.33 
 
 
694 aa  226  8e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  32.91 
 
 
599 aa  226  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  35.22 
 
 
656 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  31.61 
 
 
592 aa  226  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  29.94 
 
 
581 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  29.94 
 
 
581 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  29.94 
 
 
581 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  31.12 
 
 
578 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  35.1 
 
 
675 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  29.94 
 
 
581 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  32.16 
 
 
677 aa  225  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  34.47 
 
 
663 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  29.94 
 
 
581 aa  225  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  29.94 
 
 
581 aa  225  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  29.94 
 
 
581 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.34 
 
 
614 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  34.68 
 
 
623 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  34.56 
 
 
664 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  31.93 
 
 
686 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  33.1 
 
 
679 aa  223  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  32.82 
 
 
611 aa  223  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  32.59 
 
 
609 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  35.34 
 
 
660 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  34.91 
 
 
660 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  34.91 
 
 
660 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  30.02 
 
 
583 aa  223  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3106  DNA primase  35.57 
 
 
678 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.529982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  29.12 
 
 
579 aa  223  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  29.79 
 
 
599 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  29.56 
 
 
601 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  30.28 
 
 
600 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  29.72 
 
 
581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  34.99 
 
 
595 aa  222  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  29.72 
 
 
581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  32.64 
 
 
601 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  33.15 
 
 
577 aa  221  3e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  31.58 
 
 
600 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  30.99 
 
 
598 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  33.15 
 
 
577 aa  221  3e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  35.05 
 
 
655 aa  221  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  33.69 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  33.69 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  30.5 
 
 
584 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  30.66 
 
 
598 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  30.66 
 
 
598 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  30.66 
 
 
598 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  31.9 
 
 
640 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  30.66 
 
 
598 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  33.69 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  30.66 
 
 
598 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  33.69 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  34.99 
 
 
595 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  36.41 
 
 
677 aa  221  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  30.66 
 
 
598 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  33.69 
 
 
581 aa  221  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  30.66 
 
 
571 aa  220  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  31.47 
 
 
682 aa  220  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.65 
 
 
660 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  36.14 
 
 
677 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  36.41 
 
 
678 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  29.94 
 
 
584 aa  220  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  36.14 
 
 
677 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  30.42 
 
 
598 aa  219  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  30.42 
 
 
598 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>