More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1949 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 117 aa  236  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  97.44 
 
 		 117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  97.44 
 
 		 117 aa  231  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  89.74 
 
 		 117 aa  216  6e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  82.05 
 
 		 118 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  79.31 
 
 		 118 aa  191  3e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  74.14 
 
 		 116 aa  179  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1750  50S ribosomal protein L17  80.61 
 
 		 99 aa  167  6e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00132391  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1007  50S ribosomal protein L17  77.55 
 
 		 99 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.168469  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0328  50S ribosomal protein L17  74.14 
 
 		 116 aa  157  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  52 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  50 
 
 		 139 aa  120  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  53.45 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  51.72 
 
 		 119 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 141 aa  115  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1048  ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  48.72 
 
 		 126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  48.65 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 129 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 132 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  47.5 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 116 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  49.54 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  48.28 
 
 		 143 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  49.14 
 
 		 137 aa  113  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 136 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1256  50S ribosomal protein L17  47.01 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  0.275749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3416  50S ribosomal protein L17P  48.28 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  52.59 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  46.36 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  44.44 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  49.09 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  50.43 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0627  50S ribosomal protein L17P  49.14 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  48.28 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 166 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4216  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.719281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  43.1 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 139 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0348  ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000289431  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  45.95 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0433  50S ribosomal protein L17  45 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  47.75 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0346  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.962629  unclonable  0.0000000436647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0502  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5044  50S ribosomal protein L17  47.41 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0085  50S ribosomal protein L17  50.86 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000013942  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  43.97 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3978  ribosomal protein L17  47.06 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2604  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3749  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3719  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  48.28 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  49.07 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  45.69 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>