More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1945 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 121 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  99.17 
 
 		 121 aa  241  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  98.35 
 
 		 121 aa  237  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  91.74 
 
 		 122 aa  226  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 		 122 aa  218  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 		 122 aa  217  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  87.6 
 
 		 127 aa  215  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  82.64 
 
 		 122 aa  206  9e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  82.35 
 
 		 120 aa  201  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  67.5 
 
 		 125 aa  169  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  67.5 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 123 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 		 122 aa  163  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 124 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 123 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 121 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  60.83 
 
 		 121 aa  158  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 123 aa  157  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 		 127 aa  157  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 122 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 122 aa  153  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  60 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 123 aa  153  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 122 aa  153  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 122 aa  153  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  60 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  58.68 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  63.48 
 
 		 116 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 123 aa  147  6e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  58.33 
 
 		 123 aa  146  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  146  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  59.65 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 		 126 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  60 
 
 		 121 aa  144  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  55 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 126 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 121 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000000566138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  55 
 
 		 124 aa  144  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 		 121 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>