More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1889 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  51.32 
 
 
656 aa  644    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 
664 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0628  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
660 aa  690    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185058  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5367  acetate/CoA ligase  53.45 
 
 
655 aa  672    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.657438  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  55.02 
 
 
664 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  51.08 
 
 
662 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1952  acetyl-CoA synthetase  52.86 
 
 
660 aa  693    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.300277  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  54.08 
 
 
657 aa  694    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1708  acetyl-CoA synthetase  97.11 
 
 
657 aa  1323    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.224049  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
651 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1138  acetate--CoA ligase  53.59 
 
 
657 aa  706    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0983  acetate/CoA ligase  52.45 
 
 
665 aa  685    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1794  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
660 aa  690    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.562409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1761  acetate--CoA ligase  52.23 
 
 
660 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  55.49 
 
 
660 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1629  acetyl-CoA synthetase  54.13 
 
 
654 aa  716    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.342959  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 
656 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.02 
 
 
658 aa  689    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2229  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 
660 aa  696    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.7 
 
 
655 aa  683    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  55.32 
 
 
660 aa  720    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  54.14 
 
 
657 aa  700    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1939  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
660 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  53.55 
 
 
657 aa  712    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2747  acetate--CoA ligase  52.45 
 
 
666 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2526  acetate/CoA ligase  51.83 
 
 
666 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2109  acetyl-CoA synthetase  52.89 
 
 
660 aa  667    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.712905  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5520  acetyl-CoA synthetase  51.67 
 
 
660 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5976  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 
680 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0371909 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  53.79 
 
 
673 aa  713    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0467  acetate/CoA ligase  51.61 
 
 
643 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  53.48 
 
 
657 aa  690    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  51.31 
 
 
661 aa  668    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  52.99 
 
 
653 aa  697    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  66 
 
 
651 aa  922    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  55.66 
 
 
660 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  53.17 
 
 
656 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2230  acetate/CoA ligase  49.38 
 
 
680 aa  637    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2017  acetyl-CoA synthetase  52.28 
 
 
660 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0682887  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1385  acetyl-coenzyme A synthetase  54.33 
 
 
633 aa  686    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0788  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
660 aa  690    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0756  acetate--CoA ligase  53.76 
 
 
634 aa  684    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  51.71 
 
 
649 aa  649    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  51.27 
 
 
645 aa  638    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3218  acetate--CoA ligase  51.45 
 
 
664 aa  670    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.1 
 
 
658 aa  686    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2581  acetate--CoA ligase  53.61 
 
 
665 aa  689    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.322874  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3063  acetate--CoA ligase  53.52 
 
 
658 aa  699    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0530  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
660 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  53.56 
 
 
654 aa  700    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2049  acetyl-coenzyme A synthetase  52.84 
 
 
665 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0296505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1862  acetyl-coenzyme A synthetase  52.64 
 
 
658 aa  673    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3113  acetyl-CoA synthetase  53.3 
 
 
660 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000256311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0999  acetyl-coenzyme A synthetase  51.56 
 
 
649 aa  646    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1576  acetate/CoA ligase  67.85 
 
 
648 aa  929    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000882243  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  49.62 
 
 
663 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  54.1 
 
 
658 aa  717    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5891  acetyl-CoA synthetase  51.77 
 
 
664 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2270  acetyl-CoA synthetase  52.84 
 
 
660 aa  699    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0167504  normal  0.097797 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  51.16 
 
 
652 aa  652    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  50.38 
 
 
667 aa  649    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  54.56 
 
 
664 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3238  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 
664 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 
660 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1572  acetate--CoA ligase  51.47 
 
 
660 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1775  acetyl-CoA synthetase  53.17 
 
 
660 aa  694    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.947021  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1499  acetate/CoA ligase  50.77 
 
 
661 aa  647    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00738243  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  53.32 
 
 
655 aa  697    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2054  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
660 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  55.47 
 
 
660 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1019  acetate--CoA ligase  52.27 
 
 
647 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1416  acetyl-CoA synthetase  53 
 
 
660 aa  691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280293  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1889  acetyl-CoA synthetase  100 
 
 
657 aa  1360    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2230  acetyl-CoA synthetase  51.52 
 
 
660 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6158  acetyl-CoA synthetase  51.61 
 
 
664 aa  680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560029  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 
651 aa  638    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  50.86 
 
 
649 aa  648    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5594  acetate/CoA ligase  52.67 
 
 
658 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662691  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1938  acetyl-CoA synthetase  51.92 
 
 
660 aa  684    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  51.22 
 
 
660 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  51.45 
 
 
664 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  53.17 
 
 
658 aa  716    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  51.91 
 
 
655 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1522  acetyl-CoA synthetase  97.26 
 
 
657 aa  1327    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2041  acetate/CoA ligase  54.15 
 
 
650 aa  709    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128807  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5450  acetyl-CoA synthetase  52.15 
 
 
645 aa  638    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.820254  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  51.95 
 
 
649 aa  667    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6251  acetate/CoA ligase  51.98 
 
 
664 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2652  acetyl-CoA synthetase  53.13 
 
 
654 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.822271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  55.15 
 
 
655 aa  715    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2099  acetyl-CoA synthetase  53.17 
 
 
660 aa  695    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478226  normal  0.645954 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  50.23 
 
 
646 aa  647    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1081  acetyl-CoA synthetase  52.74 
 
 
660 aa  690    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.476732  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  51.37 
 
 
660 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  53.46 
 
 
656 aa  692    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1085  acetyl-CoA synthetase  51.75 
 
 
660 aa  675    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379038  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  51.91 
 
 
655 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  50.15 
 
 
661 aa  640    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1499  acetyl-coenzyme A synthetase  52.83 
 
 
664 aa  690    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.11302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2880  acetate--CoA ligase  53.99 
 
 
664 aa  706    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.287628  normal  0.570573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>