More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1469 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.607965  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1469  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000000598832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1716  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000136572  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0436  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000026283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0023  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.234998  normal  0.014223 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2194  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000558715  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1676  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000911888  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0009  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517155  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2230  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000000875758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1329  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0434534  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0011  tRNA-Thr  95.92 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000399709  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0030  tRNA-Thr  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.582099  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0020  tRNA-Thr  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.868603  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0030  tRNA-Thr  95.92 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0034  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0078  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0007  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227553  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03880  tRNA-Thr  93.88 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0309562 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0061  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.502238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0009  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0011  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0023  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0015  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000775633  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t08  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0056  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243934  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0010  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000624159  hitchhiker  0.00328072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0058  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341614  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0057  tRNA-Thr  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000331146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0010  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0181986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0015  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000034077  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0014  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0003  tRNA-Thr  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.304948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0081  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5033  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4988  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5678  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000591942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5702  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00210319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5717  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5731  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0227  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000274573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5804  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00774483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0050  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0096  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0022  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0019  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0246771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0868  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0166054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0793  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44632e-33 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0015534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000512626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0135529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00616299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-6  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000599237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.181325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000285821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000616859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5713  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000838851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5019  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00213455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0532  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.7224099999999997e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0019  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5740  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000298609  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0435847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5002  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0108  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00964752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0138  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4563  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000215679  normal  0.0839515 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0213  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000777909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0124  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00762261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0064  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119714  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0047  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.424478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0607  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000101667  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0112  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00195399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0085  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000677619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4770  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000025693  hitchhiker  6.21743e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0128  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.601101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0142  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000202791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5634  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0048  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0068  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00328675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5818  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000508092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000584403  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0010  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000409146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0013  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.71951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0004  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.177658  hitchhiker  0.000057248 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0061  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.269417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0061  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0045  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0045  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0010  tRNA-Thr  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000231874  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>