More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1459 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0525  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.546526  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0506  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  0.0000000000000573906  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1459  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000386293  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0446  50S ribosomal protein L1  87.98 
 
 		 233 aa  417  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0241504  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1666  50S ribosomal protein L1  79.4 
 
 		 233 aa  387  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0171  50S ribosomal protein L1  84.55 
 
 		 233 aa  375  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0655529  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0178  50S ribosomal protein L1  84.98 
 
 		 233 aa  376  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0966549  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0350  ribosomal protein L1  77.06 
 
 		 234 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695995  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1319  50S ribosomal protein L1  81.39 
 
 		 234 aa  360  1e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101939  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0350  50S ribosomal protein L1  67.83 
 
 		 230 aa  333  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0156912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  59.39 
 
 		 232 aa  278  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2278  50S ribosomal protein L1  58.56 
 
 		 229 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.360769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3691  50S ribosomal protein L1  58.56 
 
 		 229 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 233 aa  275  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2545  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3200  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 232 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 232 aa  270  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 230 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  56.83 
 
 		 232 aa  270  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1441  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 232 aa  269  4e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0252476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0350  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.81183  normal  0.731209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2957  50S ribosomal protein L1  56.82 
 
 		 231 aa  268  7e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0502013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1702  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.311882  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0336  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28407  normal  0.840151 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  53.88 
 
 		 235 aa  266  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0354  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000103528  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1321  50S ribosomal protein L1  58.18 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18039 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  57.73 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  55.51 
 
 		 233 aa  265  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1058  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.30711  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 231 aa  264  7e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 241 aa  264  1e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 231 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2851  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 232 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.418553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 233 aa  262  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 231 aa  262  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 233 aa  262  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2770  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0337  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0316  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 232 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.225661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0265  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 232 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516489  normal  0.64831 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0256  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 232 aa  261  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0257763  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  54.35 
 
 		 232 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0616  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 234 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000217065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3436  50S ribosomal protein L1  53.71 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0670  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 233 aa  259  3e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.759589  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0744  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 233 aa  258  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00583178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  54.15 
 
 		 234 aa  258  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0238  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  258  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629603  normal  0.0137855 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  57.73 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2644  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0687921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3789  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.042669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3079  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.22613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3181  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3757  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1911  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3466  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0147067  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3819  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 232 aa  257  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1896  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 235 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0132214  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0261  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0303  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 232 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3361  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 232 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.235181  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1344  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0377064  normal  0.0460128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3655  50S ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 232 aa  255  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0381514  hitchhiker  0.000000879291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3870  ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 237 aa  254  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0193  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 229 aa  254  6e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000225522  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1336  50S ribosomal protein L1  54.59 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.167533  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.9 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00693  ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000527661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0365  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.716572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5086  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00155922  normal  0.872957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3348  50S ribosomal protein L1  55.46 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1347  50S ribosomal protein L1  57.52 
 
 		 230 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0699  ribosomal protein L1  52.89 
 
 		 234 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0241249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0595  50S ribosomal protein L1  51.97 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00100936  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3037  50S ribosomal protein L1  53.28 
 
 		 231 aa  251  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  55.02 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1528  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 230 aa  251  9.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  52.02 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0834  50S ribosomal protein L1  56.09 
 
 		 233 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  52.47 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0230  50S ribosomal protein L1  56 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000338743  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  50.64 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2179  ribosomal protein L1  51.09 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.965533 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0230  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.365606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1940  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.559759  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  52.4 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2970  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 231 aa  247  9e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3317  50S ribosomal protein L1  52.84 
 
 		 231 aa  247  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.809364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 226 aa  247  1e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0837  50S ribosomal protein L1P  56.77 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0423664  normal  0.0981496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3843  50S ribosomal protein L1  55.65 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528602  normal  0.697118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>