148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1279 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1279  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
584 aa  1183    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2052  TPR repeat-containing protein  98.12 
 
 
584 aa  1162    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0047  TPR repeat-containing protein  25.08 
 
 
788 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.210348  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
1212 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 
611 aa  98.6  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 
578 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1827 aa  92.8  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
1005 aa  92.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.89 
 
 
1034 aa  90.1  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 
546 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
688 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1173  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 
445 aa  88.6  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 
558 aa  88.6  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
523 aa  87.4  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 
1451 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
3145 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 
1454 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  23.47 
 
 
1764 aa  86.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 
1450 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 
740 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 
574 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  22.68 
 
 
714 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
1038 aa  81.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.66 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0045  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.717523  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1516  TPR domain-containing protein  22.86 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  24.86 
 
 
872 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  21.93 
 
 
626 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
505 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 
639 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
923 aa  79  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2700  TPR repeat-containing protein  21.43 
 
 
496 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00571929  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 
747 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
608 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2088  tetratricopeptide TPR_2  21.35 
 
 
600 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 
615 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  22.33 
 
 
1677 aa  77.8  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  25.96 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 
583 aa  77  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  22.04 
 
 
550 aa  76.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  20.1 
 
 
620 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  20.51 
 
 
607 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 
611 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2727  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 
573 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  21.57 
 
 
626 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  22.32 
 
 
637 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  21.57 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  21.57 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  21.85 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  21.19 
 
 
714 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  21.85 
 
 
626 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  21.64 
 
 
620 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
635 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 
635 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  23.24 
 
 
653 aa  74.7  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2057  hypothetical protein  21.81 
 
 
541 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 
653 aa  74.7  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2193  hypothetical protein  21.81 
 
 
552 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 
412 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4231  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 
536 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  20.24 
 
 
767 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 
780 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.07 
 
 
530 aa  72.8  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
637 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  21.94 
 
 
612 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6027  TPR repeat-containing protein  20.76 
 
 
571 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0697264  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
595 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 
662 aa  71.2  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 
566 aa  71.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  22.1 
 
 
636 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
542 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  24.4 
 
 
473 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  21.73 
 
 
546 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
545 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 
636 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  22.58 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  20.9 
 
 
607 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 
559 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 
760 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2752  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 
545 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  23.13 
 
 
615 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 
689 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0115  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 
579 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  20.92 
 
 
545 aa  67  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  21 
 
 
648 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 
502 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 
681 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1361  hypothetical protein  21.36 
 
 
499 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.995153  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
472 aa  65.5  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 
602 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.45 
 
 
545 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 
747 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  21.9 
 
 
601 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.58 
 
 
604 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0599  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 
593 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>