197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1266 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  100 
 
 		 403 aa  792    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  55.58 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  55.19 
 
 		 415 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  53.15 
 
 		 407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  51.71 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  51.71 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  51.71 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  51.71 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  51.71 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  50.48 
 
 		 436 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  53.5 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  51.37 
 
 		 424 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  53 
 
 		 423 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  53.25 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  53.98 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  53 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  51.97 
 
 		 431 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  51.97 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  51.36 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  50.85 
 
 		 435 aa  388  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  52.84 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  51.72 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  50.49 
 
 		 424 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  51.65 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  50.5 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  50.77 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  50.75 
 
 		 410 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  49.88 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  47.16 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  49.05 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  47.37 
 
 		 428 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  45.7 
 
 		 426 aa  347  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  46.27 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  45.21 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  49.61 
 
 		 413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  44.74 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  47.81 
 
 		 412 aa  332  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  45.63 
 
 		 436 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  41.54 
 
 		 468 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  44.82 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  42.97 
 
 		 412 aa  298  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  40.88 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  41.34 
 
 		 440 aa  296  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  40.6 
 
 		 471 aa  292  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  44.19 
 
 		 428 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  40.42 
 
 		 458 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  43.73 
 
 		 405 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  40.48 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  39.17 
 
 		 417 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  40.24 
 
 		 417 aa  266  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  37.56 
 
 		 413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  41.67 
 
 		 408 aa  253  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  42.17 
 
 		 408 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1395  glucose/galactose transporter  43.11 
 
 		 431 aa  246  6e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.774597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  40.34 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  36.25 
 
 		 420 aa  233  6e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  34.77 
 
 		 409 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  37.01 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  35.91 
 
 		 431 aa  227  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  36.34 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  36.34 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  36.34 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  36.34 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  36.34 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02756  L-fucose:H+ symporter permease  36.41 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  36.16 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  36.1 
 
 		 438 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  33.66 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  35.01 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  35.13 
 
 		 438 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  35.13 
 
 		 438 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  35.13 
 
 		 438 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  35.13 
 
 		 438 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  35.7 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1494  L-fucose transporter  34.55 
 
 		 414 aa  215  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  41.91 
 
 		 485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  34.52 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  34.6 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  35.12 
 
 		 437 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  34.25 
 
 		 419 aa  206  8e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  34.52 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  35 
 
 		 406 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01060  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 		 468 aa  199  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  32.93 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 426 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 488 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  34.27 
 
 		 426 aa  193  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  30.42 
 
 		 399 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  32.7 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  32.3 
 
 		 438 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  31.22 
 
 		 443 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  30.54 
 
 		 440 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0364  L-fucose permease  30.54 
 
 		 448 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  32.04 
 
 		 446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6949  L-fucose transporter  30 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  32.85 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  30.52 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  30.52 
 
 		 457 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6905  L-fucose permease  29.73 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  32.04 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>