68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1010 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  100 
 
 
150 aa  286  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  98.58 
 
 
290 aa  267  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  97.87 
 
 
290 aa  266  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.5 
 
 
314 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  31.76 
 
 
299 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.83 
 
 
520 aa  71.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  34.85 
 
 
296 aa  72  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 
530 aa  71.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.5 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  33.33 
 
 
300 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  31.3 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.33 
 
 
315 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.33 
 
 
315 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.33 
 
 
315 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.33 
 
 
315 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.09 
 
 
315 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  34.43 
 
 
304 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.16 
 
 
299 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  29.53 
 
 
325 aa  58.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.16 
 
 
307 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.16 
 
 
307 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  31.16 
 
 
307 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  31.16 
 
 
307 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  31.16 
 
 
307 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.43 
 
 
307 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.43 
 
 
307 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  33.09 
 
 
307 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  30.34 
 
 
308 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  34.04 
 
 
301 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  29.32 
 
 
308 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  29.32 
 
 
308 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  29.32 
 
 
308 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  31.62 
 
 
315 aa  56.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  29.32 
 
 
308 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  29.85 
 
 
310 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  29.09 
 
 
295 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
331 aa  55.1  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.63 
 
 
303 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.47 
 
 
308 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  29.55 
 
 
308 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  30.09 
 
 
297 aa  53.9  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  30.3 
 
 
308 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  29.55 
 
 
308 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.32 
 
 
274 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  25.95 
 
 
297 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  32.53 
 
 
358 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  31.46 
 
 
316 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  27.74 
 
 
304 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  26.03 
 
 
305 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  33.33 
 
 
315 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  22.15 
 
 
306 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  36.25 
 
 
294 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  24.14 
 
 
321 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.38 
 
 
309 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0465  hypothetical protein  30.77 
 
 
270 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0969494  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1445  hypothetical protein  35.38 
 
 
261 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.154622 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  22.22 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  26.97 
 
 
319 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
321 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  34.43 
 
 
304 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 
282 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  24.5 
 
 
302 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0534  hypothetical protein  36.92 
 
 
261 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.055739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  30.59 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2730  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.82 
 
 
310 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  27.27 
 
 
288 aa  40.4  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  32.69 
 
 
330 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>