More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0901 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1731  DNA-binding protein HU  100 
 
 
98 aa  187  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  unclonable  4.34632e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0991  DNA-binding protein HU  100 
 
 
98 aa  187  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  unclonable  3.36504e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0901  DNA-binding protein HU  100 
 
 
98 aa  187  4e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  1.06292e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1225  DNA-binding protein HU  90.59 
 
 
100 aa  149  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  5.97391e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0846  DNA-binding protein HU  65.22 
 
 
104 aa  122  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  3.4735e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0798  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II) (HB)  62.37 
 
 
107 aa  114  4e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  4.1032e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1514  histone family protein DNA-binding protein  56.04 
 
 
91 aa  107  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.08882e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0021  DNA-binding protein HU 1 (DNA-binding protein II; HB)  63.22 
 
 
100 aa  107  7e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  1.60012e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2154  histone family protein DNA-binding protein  55.06 
 
 
90 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  5.52537e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0465  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
90 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0115  histone family protein DNA-binding protein  56.67 
 
 
95 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552761  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1826  hypothetical protein  53.26 
 
 
92 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1822  hypothetical protein  53.26 
 
 
92 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1530  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
90 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0967  histone family protein DNA-binding protein  56.52 
 
 
92 aa  100  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1560  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
90 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.768925  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1041  DNA-binding protein HU  53.93 
 
 
90 aa  100  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1181  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
92 aa  97.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.42545  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1180  histone-like DNA-binding protein  51.69 
 
 
90 aa  97.1  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  2.95654e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0765  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 
91 aa  97.1  7e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.96782e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3229  histone family protein DNA-binding protein  52.81 
 
 
91 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0532  DNA-binding protein HU-beta  51.69 
 
 
90 aa  95.9  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00043104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0075  histone family protein DNA-binding protein  50.55 
 
 
91 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0648  histone family protein DNA-binding protein  49.45 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.17185e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1434  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.087278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1604  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000159132 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1392  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  5.12711e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1531  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.259543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3779  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000354145  normal  0.961445 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1392  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.011833  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1566  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1420  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.190218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1637  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00420342  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1673  DNA-binding protein HU  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.25838e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1233  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0133564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1870  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0130937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2069  histone family protein DNA-binding protein  48.42 
 
 
95 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0070  nucleoid protein Hbs  51.69 
 
 
92 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0240129  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1763  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.203917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0525  nucleoid protein Hbs  54.55 
 
 
91 aa  92.8  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00046461  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0324  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 
90 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064189  normal  0.0110025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1926  histone family protein DNA-binding protein  53.93 
 
 
92 aa  92  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.01993e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0085  nucleoid protein Hbs  49.45 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0539634  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3132  DNA-binding protein HU  51.55 
 
 
94 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1837  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
90 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00431989  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1653  histone-like DNA-binding protein  47.13 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  4.7794e-07  unclonable  4.40637e-05 
 
 
 
NC_010180  BcerKBAB4_5693  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
90 aa  90.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0471576  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1900  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
90 aa  90.9  6e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0802524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2403  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  2.37544e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2043  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 
90 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2511  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 
92 aa  90.5  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.954e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3473  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.59147e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3486  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.48823e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1474  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.12809e-10  hitchhiker  4.84208e-06 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3827  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  8.18253e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3574  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.04463e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1175  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 
91 aa  90.5  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  2.11181e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3858  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  5.87043e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3778  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  7.04337e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3740  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45695e-15 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3756  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
90 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  2.31467e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2285  histone family protein DNA-binding protein  46.07 
 
 
90 aa  90.1  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556838  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1918  histone family protein DNA-binding protein  50.56 
 
 
91 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  8.97645e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0355  histone-like DNA-binding protein  51.11 
 
 
94 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00204011  normal  0.390975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2342  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.868034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2657  nucleoid protein Hbs  47.25 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000194133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2983  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0894  nucleoid DNA-binding protein  50 
 
 
91 aa  89.7  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.08972e-16  hitchhiker  2.65027e-13 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_28  DNA-binding protein HU-alpha  47.19 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1474  putative DNA-binding protein HU-beta  45.98 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  9.97119e-14  hitchhiker  9.85943e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0293  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
94 aa  89.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.416752  normal  0.0238993 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3494  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  6.68206e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1641  DNA-binding protein HU  45.05 
 
 
94 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  7.02248e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1772  histone-like DNA-binding protein  48.31 
 
 
90 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000757515  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0074  DNA-binding protein HU  49.44 
 
 
90 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  4.81156e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2184  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 
90 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170143  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0508  DNA-binding protein HU  45.05 
 
 
94 aa  89  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  3.77509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1064  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2203  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0471577  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1957  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 
91 aa  88.6  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  2.4611e-05  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0219  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
96 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.132966  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2407  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2477  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2377  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2136  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2395  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2213  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0186  histone family protein DNA-binding protein  48.28 
 
 
90 aa  88.2  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2152  DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0274093  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1967  histone family protein DNA-binding protein  47.25 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00606172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2107  histone family protein DNA-binding protein  44.94 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  8.44989e-06  hitchhiker  0.00906741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1745  histone family protein DNA-binding protein  49.44 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.693876  hitchhiker  0.00044049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09623  probable DNA-binding protein HU  48.31 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.355669  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2752  histone-like DNA-binding protein  48.89 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1726  histone family protein DNA-binding protein  47.19 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  3.26644e-09  hitchhiker  0.00672024 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0201  histone family protein DNA-binding protein  48.31 
 
 
91 aa  87  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  4.29798e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4407  histone family protein DNA-binding protein  50 
 
 
94 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.92025e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1290  nucleoid protein Hbs  46.59 
 
 
91 aa  87  8e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  8.54913e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1105  DNA-binding protein HU  47.19 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.965912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1553  histone-like DNA-binding protein  49.44 
 
 
91 aa  86.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>