65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0800 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  100 
 
 
509 aa  999    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  54.37 
 
 
520 aa  547  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  50.5 
 
 
518 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  50.3 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  43.33 
 
 
519 aa  444  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  43.17 
 
 
515 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  43.74 
 
 
519 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  41.73 
 
 
519 aa  425  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  41.65 
 
 
519 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  41.34 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  39.09 
 
 
520 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  39.17 
 
 
519 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  39.24 
 
 
518 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  39.57 
 
 
519 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  39.24 
 
 
512 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  39.01 
 
 
519 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  39.01 
 
 
519 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  39.01 
 
 
519 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  35.15 
 
 
519 aa  317  3e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  35.64 
 
 
518 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  36.56 
 
 
516 aa  301  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  35.83 
 
 
511 aa  300  5e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  35.8 
 
 
512 aa  296  4e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  34.64 
 
 
529 aa  293  4e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  35.26 
 
 
512 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  35.26 
 
 
512 aa  291  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  35.98 
 
 
534 aa  290  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  35.62 
 
 
539 aa  280  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  35.23 
 
 
535 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  33.98 
 
 
534 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  35.94 
 
 
535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  35.74 
 
 
540 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  35.74 
 
 
540 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  35.74 
 
 
540 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  34.9 
 
 
535 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  35.62 
 
 
539 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  34.12 
 
 
530 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  33.66 
 
 
528 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  36.33 
 
 
511 aa  268  1e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  34.7 
 
 
537 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  34.31 
 
 
535 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  34.89 
 
 
538 aa  267  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  33.98 
 
 
522 aa  266  8.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  34.56 
 
 
532 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  34.83 
 
 
538 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  33.27 
 
 
525 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  28.17 
 
 
514 aa  253  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  31.39 
 
 
507 aa  249  6e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  30.6 
 
 
506 aa  248  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  28.86 
 
 
508 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  31.3 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  29.76 
 
 
510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  29.76 
 
 
508 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  29.76 
 
 
508 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  29.76 
 
 
508 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  30.36 
 
 
510 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  29.76 
 
 
508 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  29.76 
 
 
508 aa  243  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  29.76 
 
 
508 aa  243  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  28.28 
 
 
523 aa  226  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  29.95 
 
 
585 aa  206  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  27.22 
 
 
552 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  33.79 
 
 
263 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  27.34 
 
 
305 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3033  short chain fatty acid transporter  25.93 
 
 
448 aa  43.5  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.625274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>