More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0662 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1240  isoleucyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
938 aa  675    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.227379  normal  0.0730033 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00030  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
938 aa  661    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00300896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3573  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
938 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.017185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3596  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
924 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000749042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3136  isoleucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
923 aa  673    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0131588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0603  isoleucyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
943 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633641  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0775  isoleucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
937 aa  670    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2253  isoleucyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 
939 aa  680    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0514464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3650  isoleucyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
925 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000233753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3940  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
921 aa  661    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0428379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1182  isoleucyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
953 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1204  isoleucyl-tRNA synthetase  97.38 
 
 
917 aa  1807    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
924 aa  685    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 
947 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3532  isoleucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
940 aa  684    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0806  isoleucyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
943 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.3269  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3746  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
921 aa  661    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3637  isoleucyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
921 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1099  isoleucyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
940 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0237833  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3654  isoleucyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
921 aa  661    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0049  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
956 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.479599  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0028  isoleucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
938 aa  663    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0184357  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0030  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
938 aa  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000755713  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0189  isoleucyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
909 aa  639    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.480596  normal  0.804628 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
938 aa  661    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0710  isoleucyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
943 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0257753  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0364  isoleucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
941 aa  655    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3046  isoleucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
932 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.140693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
938 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3722  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
921 aa  653    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3271  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
944 aa  663    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1857  isoleucyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
929 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1054  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
940 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0698363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
940 aa  697    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
908 aa  671    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3588  isoleucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
938 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2277  isoleucyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
940 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0050  isoleucyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
956 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0050  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
956 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.632175  normal  0.280054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2455  isoleucyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
927 aa  700    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000538719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00980  isoleucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
942 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1087  isoleucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
939 aa  700    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1291  isoleucyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
940 aa  677    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326353  normal  0.133319 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0351  isoleucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
923 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2142  isoleucyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 
934 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0495  isoleucyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
943 aa  656    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4034  isoleucyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
921 aa  661    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0225299  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0780  isoleucyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 
919 aa  1105    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00333946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0787  isoleucyl-tRNA synthetase  40.15 
 
 
931 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0590417  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 
919 aa  690    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2654  isoleucyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
943 aa  677    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 
940 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  0.0000563381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
946 aa  681    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0863  isoleucyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
930 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000147898  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0662  isoleucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
917 aa  1892    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.756036  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0711  isoleucyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
937 aa  645    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.573133  hitchhiker  0.00000334953 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0580  isoleucyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
952 aa  662    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0642875  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  67.07 
 
 
919 aa  1285    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0862  isoleucyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
939 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.89203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
943 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0790  isoleucyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 
938 aa  668    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102283  normal  0.791214 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2566  isoleucyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
932 aa  660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1080  isoleucyl-tRNA synthetase  97.27 
 
 
917 aa  1829    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
920 aa  667    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0050  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
956 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0223233 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
913 aa  652    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2723  isoleucyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
943 aa  682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00134362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0924  isoleucyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
940 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
919 aa  665    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3235  isoleucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
940 aa  693    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.489815  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1836  isoleucyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 
941 aa  694    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0402  isoleucyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
947 aa  662    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.354938  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1156  isoleucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
940 aa  692    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102476  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
926 aa  644    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0649  isoleucyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
943 aa  656    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0584  isoleucyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 
948 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0128846  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0698  isoleucyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
938 aa  667    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105082  normal  0.0586161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
940 aa  695    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3947  isoleucyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 
921 aa  662    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000642844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0024  isoleucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
938 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0199251  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0186  isoleucyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
937 aa  657    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.397485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
938 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000276203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2957  isoleucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
940 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139756  normal  0.394087 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3039  isoleucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
940 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0469358  normal  0.419814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0852  isoleucyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
941 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2890  isoleucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
943 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.063725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
921 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0906  isoleucyl-tRNA synthetase  65.69 
 
 
921 aa  1260    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0981  isoleucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
924 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3629  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
938 aa  661    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124102  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
940 aa  694    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0051  isoleucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
956 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0561272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1059  isoleucyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
940 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0131865  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
929 aa  672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
949 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000786038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4559  isoleucyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
943 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.349463  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0122  isoleucyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
928 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0115496  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2147  isoleucyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
954 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.307917  normal  0.705787 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3136  isoleucyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
940 aa  684    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0610  isoleucyl-tRNA synthetase  67.57 
 
 
916 aa  1288    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000217018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>