222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0458 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0940  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase small chain  79.52 
 
 
383 aa  648  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0025548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0458  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  100 
 
 
379 aa  792  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  4.04232e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0712  Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  81 
 
 
379 aa  643  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1903  thymidylate kinase (dTMP kinase)  80.05 
 
 
381 aa  635  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0537168  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1283  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  99.17 
 
 
360 aa  749  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0034668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1403  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  98.89 
 
 
360 aa  748  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0101  putative periplasmic protein  79.2 
 
 
401 aa  628  1e-179  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0861  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase small chain  73.92 
 
 
381 aa  602  1e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.822531  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1106  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  76.26 
 
 
385 aa  584  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.978131  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1436  Ni-Fe hydrogenase, small subunit  72.15 
 
 
383 aa  566  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1765  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.84 
 
 
378 aa  498  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1908  hydrogen:quinone oxidoreductase  59.31 
 
 
378 aa  497  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.935417  normal  0.0653543 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1922  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.57 
 
 
378 aa  491  1e-138  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2404  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.57 
 
 
378 aa  491  1e-138  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0274072  hitchhiker  0.000408774 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1889  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.57 
 
 
378 aa  491  1e-138  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.118271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1679  hydrogen:quinone oxidoreductase  59.57 
 
 
378 aa  491  1e-138  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1880  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.84 
 
 
378 aa  491  1e-138  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1915  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.57 
 
 
378 aa  491  1e-138  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0904727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1822  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.31 
 
 
378 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.249477  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2088  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.57 
 
 
378 aa  490  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.332576  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2155  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  59.31 
 
 
378 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.021449  normal  0.34251 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2099  quinone-reactive Ni/Fe hydrogenase, small subunit precursor  59.31 
 
 
378 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2033  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  58.78 
 
 
378 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000339723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2103  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  57.71 
 
 
378 aa  466  1e-130  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2056  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  48.6 
 
 
373 aa  360  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0545  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  48.03 
 
 
373 aa  358  7e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0872  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  46.09 
 
 
377 aa  358  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3332  Ni-Fe hydrogenase, small subunit:twin-arginine translocation pathway signal  47.71 
 
 
379 aa  353  3e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2953  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  50.32 
 
 
312 aa  340  3e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.617485 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0414  quinone-reactive Ni/Fe-hydrogenase, small subunit  51.69 
 
 
544 aa  337  2e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.791101  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1733  hydrogenase, (NiFe)/(NiFeSe) small subunit family  54.39 
 
 
497 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0782  nickel-dependent hydrogenase, small subunit  51.29 
 
 
367 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0547122  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1586  hydrogenase, (NiFe)/(NiFeSe) small subunit family  53.68 
 
 
497 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1398  hydrogenase, (NiFe)/(NiFeSe) small subunit family  54.04 
 
 
497 aa  331  1e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3403  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  47.29 
 
 
400 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3906  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  45.73 
 
 
375 aa  325  1e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2319  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  44.38 
 
 
415 aa  321  1e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0123  nickel-dependent hydrogenase, small subunit  45.14 
 
 
361 aa  319  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.799752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3148  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  45.76 
 
 
417 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1150  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  43.26 
 
 
358 aa  316  5e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.172681  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0144  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  52.58 
 
 
376 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2038  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  45.4 
 
 
813 aa  314  2e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1123  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  52.07 
 
 
368 aa  312  7e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0265  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  50.48 
 
 
317 aa  312  7e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.595947  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1154  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  44.07 
 
 
370 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3139  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  51.72 
 
 
368 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0767  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  50 
 
 
319 aa  310  3e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0054  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  43.77 
 
 
356 aa  306  4e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  2.50606e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3772  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  42.94 
 
 
374 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.427783  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1943  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  51.53 
 
 
378 aa  304  2e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.162149  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1348  hydrogenase-1 small chain  43.72 
 
 
381 aa  303  3e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1984  hydrogenase-1 small chain  43.72 
 
 
400 aa  303  4e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.286053  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1928  hydrogenase-1 small chain  43.72 
 
 
400 aa  303  4e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1924  hydrogenase-1 small chain  43.72 
 
 
381 aa  302  5e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2173  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  45.35 
 
 
370 aa  302  6e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00215445  normal  0.569492 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3376  hypothetical protein  43.63 
 
 
368 aa  301  8e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1975  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  49.01 
 
 
364 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.847489  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3989  Ni-Fe hydrogenase, small subunit:twin-arginine translocation pathway signal  44.74 
 
 
363 aa  300  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3367  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  43.43 
 
 
359 aa  300  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2146  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  44.26 
 
 
369 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.206578  normal  0.329607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0495  hydrogenase protein small subunit  43.98 
 
 
369 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0338  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  48.04 
 
 
373 aa  298  9e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  7.09279e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0166  nickel-iron hydrogenase, small subunit  47.55 
 
 
362 aa  298  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.410491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0853  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  44.48 
 
 
364 aa  298  1e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113934  normal  0.390076 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1532  hydrogenase-1 small chain  43.17 
 
 
400 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.917812  normal  0.164439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50590  Uptake hydrogenase small subunit (Precursor), HoxK  48.56 
 
 
358 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2827  hydrogenase (acceptor)  48.68 
 
 
364 aa  297  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1996  uptake hydrogenase small subunit precursor  45.51 
 
 
363 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00346  Ni-Fe hydrogenase, small subunit  45.9 
 
 
340 aa  296  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1269  Hydrogenase (acceptor)  43.15 
 
 
355 aa  295  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1298  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  45.02 
 
 
364 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102659  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0972  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  45.81 
 
 
360 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00108314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1162  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  43.84 
 
 
377 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1862  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  44.91 
 
 
362 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0855  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  45.67 
 
 
361 aa  291  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1446  Ni-Fe hydrogenase, small subunit  45.4 
 
 
362 aa  289  5e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.123847  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1080  nickel-dependent hydrogenase 1, small subunit  45 
 
 
372 aa  288  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.028623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2343  nickel-dependent hydrogenase, small subunit  45 
 
 
372 aa  288  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0233788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00982  hypothetical protein  45 
 
 
372 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.111727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2145  nickel-dependent hydrogenase 1, small subunit  45 
 
 
372 aa  288  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191691  normal  0.521589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00975  hydrogenase 1, small subunit  45 
 
 
372 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0863695  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2625  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  45 
 
 
372 aa  288  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.245904  hitchhiker  0.000111305 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2672  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  45 
 
 
372 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  5.45248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7265  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  43.54 
 
 
386 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.530121  normal  0.303064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1378  Ni-Fe hydrogenase, small subunit  44.69 
 
 
360 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38439  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1161  Ni-Fe hydrogenase, small subunit  44.79 
 
 
361 aa  286  3e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1087  nickel-dependent hydrogenase, small subunit  44.71 
 
 
372 aa  286  4e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.20987e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3974  Ni-Fe hydrogenase, small subunit:twin-arginine translocation pathway signal  47.25 
 
 
394 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871152  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1593  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  44.85 
 
 
363 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.550279  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4088  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  48.49 
 
 
393 aa  285  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.541909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2137  hydrogenase (NiFe) small subunit (hydA)  47.21 
 
 
317 aa  285  1e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1208  nickel-dependent hydrogenase 1, small subunit  44.71 
 
 
372 aa  285  1e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.428667  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3097  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  43.42 
 
 
361 aa  284  2e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0837  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  42.73 
 
 
367 aa  283  4e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0271  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  46.62 
 
 
317 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.113366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1797  uptake hydrogenase small subunit  46.41 
 
 
367 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.899468  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1643  uptake hydrogenase small subunit  46.41 
 
 
367 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1246  hydrogenase (NiFe) small subunit HydA  47.54 
 
 
317 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1710  uptake hydrogenase small subunit  46.41 
 
 
367 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1632  uptake hydrogenase small subunit  46.41 
 
 
367 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>