More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0344 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0344  phage integrase  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0123208  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2077  putative phage integrase  57.73 
 
 
302 aa  324  9e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0706  site-specific recombinase, phage integrase family protein  57.39 
 
 
297 aa  322  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0638  lipoprotein  57.39 
 
 
297 aa  322  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.713246  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2082  site-specific recombinase, phage integrase family protein  58.46 
 
 
260 aa  299  4e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  34.26 
 
 
338 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  35.08 
 
 
369 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1995  integrase family protein  34.55 
 
 
359 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  32.33 
 
 
393 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  34.88 
 
 
411 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  28.76 
 
 
356 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  29.31 
 
 
392 aa  99.4  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  32.98 
 
 
471 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  27.8 
 
 
412 aa  99  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  26.12 
 
 
402 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  30.69 
 
 
381 aa  97.8  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  30.7 
 
 
435 aa  96.3  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  29.17 
 
 
392 aa  96.3  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  26.12 
 
 
401 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  32.6 
 
 
433 aa  95.9  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  28.12 
 
 
391 aa  95.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  29.57 
 
 
392 aa  94.4  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  29.96 
 
 
390 aa  93.6  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  30.91 
 
 
407 aa  92.4  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  22.58 
 
 
365 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0746  phage integrase family protein  30.46 
 
 
384 aa  90.5  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  32.37 
 
 
414 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2315  integrase family protein  26.86 
 
 
255 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.01 
 
 
390 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2022  phage integrase family protein  30.43 
 
 
407 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0581728  decreased coverage  0.0000000356379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  30.41 
 
 
386 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01322  integrase  26.14 
 
 
411 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2298  integrase family protein  26.14 
 
 
411 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000253071  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  30.97 
 
 
385 aa  87  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01332  hypothetical protein  26.14 
 
 
411 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  28.07 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  21.83 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  22.14 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  28.03 
 
 
378 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.57 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  26.96 
 
 
341 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  20.89 
 
 
378 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  23.26 
 
 
433 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  29.36 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  25.25 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  26.29 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  32.34 
 
 
401 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3251  Int protein  24.02 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383765  hitchhiker  0.0000530695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  29.17 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  26.86 
 
 
403 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  29.58 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1301  integrase family protein  26.41 
 
 
396 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.74 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1786  phage integrase family site specific recombinase  25.1 
 
 
426 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2064  integrase family protein  24.69 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00115414  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2264  integrase family protein  25 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.12232  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  27.42 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2052  integrase family protein  24.69 
 
 
431 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00969136  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1783  Phage integrase  29.38 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.552394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.09 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.22 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.22 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  26.39 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  25.52 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  23.29 
 
 
402 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.84 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  30.92 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  20.92 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.78 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2093  integrase family protein  25.11 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.379176  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  28.25 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.78 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.78 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.62 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  26.22 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2393  phage integrase family site specific recombinase  24.59 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.682709  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  24.1 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  21.76 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  25.75 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  21.54 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1074  integrase  22.67 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000184312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.91 
 
 
443 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1042  integrase  22.67 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000195373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1107  integrase  22.67 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.781225 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  26.67 
 
 
398 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  27.24 
 
 
346 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1561  site-specific recombinase phage integrase family protein  26.28 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.885578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  30.58 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  26.56 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  30.58 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5560  integrase family protein  22.87 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  21.43 
 
 
398 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  24.71 
 
 
332 aa  66.2  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.82 
 
 
385 aa  65.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  23.95 
 
 
431 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  27.31 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3063  integrase family protein  26.2 
 
 
257 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000494154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2605  integrase family protein  28.57 
 
 
376 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0311051  normal  0.282598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1951  phage integrase family protein  24.1 
 
 
430 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000646207  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  21.55 
 
 
385 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>