More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0216 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0216  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
602 aa  1231  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0611  threonyl-tRNA synthetase  76.94 
 
 
609 aa  978  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.260291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
645 aa  642  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  7.4774e-09  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0066  threonyl-tRNA synthetase  66.17 
 
 
602 aa  854  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  2.16362e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
636 aa  653  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0028  threonyl-tRNA synthetase  86.73 
 
 
603 aa  1086  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
636 aa  645  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1702  threonyl-tRNA synthetase  76.04 
 
 
617 aa  969  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000310236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  54.28 
 
 
636 aa  652  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  53.32 
 
 
646 aa  638  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0238  threonyl-tRNA synthetase  97.67 
 
 
602 aa  1208  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0330  threonyl-tRNA synthetase  75.66 
 
 
606 aa  955  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000295964  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  52.65 
 
 
645 aa  647  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  2.55721e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1819  threonyl-tRNA synthetase  76.16 
 
 
606 aa  964  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0199  threonyl-tRNA synthetase  98.5 
 
 
602 aa  1213  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0081  threonyl-tRNA synthetase  73.22 
 
 
605 aa  927  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  7.16431e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  52.36 
 
 
636 aa  639  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
644 aa  628  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
649 aa  620  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0984  threonyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
644 aa  613  1e-174  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.234013 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
644 aa  613  1e-174  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
644 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
638 aa  607  1e-172  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.02997e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
644 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0490  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
647 aa  593  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00808985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
635 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.78172e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1907  threonyl-tRNA synthetase  47.9 
 
 
637 aa  582  1e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  1.67344e-05 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
643 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
638 aa  578  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  47.95 
 
 
635 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  7.17334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2823  threonyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 
643 aa  577  1e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.77582e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
644 aa  577  1e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  9.9925e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
639 aa  572  1e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.79764e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
640 aa  572  1e-162  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0392  threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
633 aa  570  1e-161  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3194  threonyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
637 aa  570  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 
643 aa  571  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
640 aa  571  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
633 aa  572  1e-161  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  9.91077e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2354  threonyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
640 aa  566  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0608  threonyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
634 aa  567  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.769524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2405  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  567  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2388  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  568  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2161  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  567  1e-160  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.820955  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 
637 aa  568  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.37846e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2419  threonyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
640 aa  567  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2222  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  568  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2145  threonyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 
639 aa  567  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
635 aa  562  1e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
635 aa  563  1e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2973  threonyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
640 aa  562  1e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2193  threonyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 
639 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
634 aa  560  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2489  threonyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
639 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.952507  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0627  threonyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
588 aa  556  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 
636 aa  556  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
644 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 
635 aa  552  1e-156  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  3.83369e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1767  threonyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
640 aa  552  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  47.24 
 
 
644 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
634 aa  549  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.36416e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1664  threonyl-tRNA synthetase  46.66 
 
 
640 aa  547  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000605435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0835  threonyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
640 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
638 aa  544  1e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
638 aa  545  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
636 aa  544  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
637 aa  538  1e-152  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16370  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  48.08 
 
 
586 aa  539  1e-152  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.12349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
646 aa  538  1e-152  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0723  threonyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 
631 aa  540  1e-152  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  4.76694e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 
637 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 
648 aa  536  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_659  threonyl-tRNA synthetase (thrS)  49.64 
 
 
582 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  3.28118e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
637 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
642 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
640 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
669 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04450  threonyl-tRNA synthetase /Ser-tRNA(Thr) hydrolase  46.58 
 
 
586 aa  534  1e-150  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0386598  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
640 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
635 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0681  threonyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
582 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  3.23411e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
643 aa  529  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 
640 aa  530  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
640 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
640 aa  526  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
638 aa  528  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0753  threonyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
582 aa  525  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.105849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3623  threonyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
643 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
640 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
638 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1870  threonyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 
635 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1643  threonyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 
645 aa  528  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193799  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
640 aa  528  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3481  threonyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
640 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800828  normal  0.0249513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
640 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  42.93 
 
 
640 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  7.37785e-09 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1967  threonyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
640 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134711  normal  0.0132251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
635 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
662 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1745  threonyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
637 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>