More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0204 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  97.89 
 
 
190 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  96.32 
 
 
190 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  86.32 
 
 
190 aa  342  2e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  74.33 
 
 
195 aa  308  4e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  74.21 
 
 
190 aa  303  9.000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  73.68 
 
 
190 aa  298  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  69.31 
 
 
193 aa  283  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  69.83 
 
 
179 aa  268  4e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  67.38 
 
 
194 aa  266  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  60.22 
 
 
239 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  60.22 
 
 
239 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  59.67 
 
 
247 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  58.56 
 
 
213 aa  239  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  61.36 
 
 
235 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  61.49 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  59.66 
 
 
235 aa  232  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  59.2 
 
 
201 aa  232  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  58.66 
 
 
219 aa  231  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  59.44 
 
 
226 aa  231  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  58.24 
 
 
213 aa  231  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  61.14 
 
 
212 aa  231  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 
202 aa  231  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  61.14 
 
 
218 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  60.23 
 
 
219 aa  230  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  57.14 
 
 
223 aa  229  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  57.95 
 
 
235 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 
198 aa  228  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  56.52 
 
 
214 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  58.56 
 
 
199 aa  228  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  56.52 
 
 
214 aa  228  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  62.15 
 
 
220 aa  227  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  59.2 
 
 
218 aa  226  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  58.29 
 
 
216 aa  225  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  56.99 
 
 
186 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  58.76 
 
 
223 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  59.88 
 
 
187 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  55.56 
 
 
243 aa  223  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 
226 aa  223  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  59.52 
 
 
186 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  54.95 
 
 
184 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  58.93 
 
 
186 aa  222  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  54.95 
 
 
188 aa  222  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  59.65 
 
 
187 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  58.93 
 
 
186 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  54.4 
 
 
270 aa  221  7e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  54.89 
 
 
185 aa  220  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 
181 aa  220  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  59.06 
 
 
186 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  59.06 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  56.73 
 
 
179 aa  218  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
181 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  56.18 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  55.68 
 
 
224 aa  217  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 
189 aa  216  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  58.33 
 
 
186 aa  216  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  51.63 
 
 
184 aa  215  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  56.07 
 
 
180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  58.08 
 
 
181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 
185 aa  214  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  58.68 
 
 
181 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 
225 aa  214  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  58.58 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  56.57 
 
 
210 aa  214  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  58.08 
 
 
181 aa  213  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  57.89 
 
 
181 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  52.17 
 
 
206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  58.01 
 
 
200 aa  211  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  57.47 
 
 
195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  55.81 
 
 
193 aa  211  5.999999999999999e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  53.49 
 
 
184 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  51.1 
 
 
435 aa  211  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  54.19 
 
 
181 aa  210  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  52.57 
 
 
186 aa  210  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
182 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
181 aa  207  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
179 aa  205  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
201 aa  204  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 
203 aa  204  6e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
179 aa  204  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  50.28 
 
 
329 aa  202  2e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
188 aa  201  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 
189 aa  201  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  49.45 
 
 
185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  57.31 
 
 
181 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
199 aa  198  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  57.31 
 
 
181 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  47.59 
 
 
203 aa  199  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  49.45 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  57.31 
 
 
190 aa  197  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1044  GTP cyclohydrolase  47.54 
 
 
203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.663333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  54.5 
 
 
187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  52.75 
 
 
185 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000239263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  53.11 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  53.41 
 
 
198 aa  193  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
188 aa  192  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
188 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 
219 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  51.91 
 
 
210 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>