More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0032 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_r04  16S ribosomal RNA  94.34 
 
 		 1723 bp  1961    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1465  16S ribosomal RNA  98.41 
 
 		 1513 bp  2809    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0517  16S ribosomal RNA  98.41 
 
 		 1513 bp  2809    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.635993  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1800  16S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 1511 bp  1887    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0460  16S ribosomal RNA  98.41 
 
 		 1513 bp  2809    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1275  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1513 bp  2999    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1524  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1513 bp  2999    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2342  16S ribosomal RNA  93.49 
 
 		 1458 bp  2107    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0032  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1513 bp  2999    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1803  16S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 1511 bp  1887    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0148502  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1806  16S ribosomal RNA  91.07 
 
 		 1511 bp  1887    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1711  16S ribosomal RNA  99.6 
 
 		 1511 bp  2936    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0592  16S ribosomal RNA  93.99 
 
 		 1461 bp  2190    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.518963  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0042  16S ribosomal RNA  88.83 
 
 		 1497 bp  1590    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SA  16S ribosomal RNA  99.8 
 
 		 1513 bp  2976    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SB  16S ribosomal RNA  99.8 
 
 		 1513 bp  2976    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_Cj16SC  16S ribosomal RNA  99.8 
 
 		 1513 bp  2976    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r06  16S ribosomal RNA  94.34 
 
 		 1723 bp  1961    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2336  16S ribosomal RNA  93.49 
 
 		 1458 bp  2107    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0055  16S ribosomal RNA  88.9 
 
 		 1497 bp  1598    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0037  16S ribosomal RNA  88.83 
 
 		 1497 bp  1590    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0018  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1448 bp  1070    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0022  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1448 bp  1070    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0031  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1448 bp  1070    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0059  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1448 bp  1070    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_r01  16S ribosomal RNA  94.34 
 
 		 1723 bp  1961    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0506  16S ribosomal RNA  93.99 
 
 		 1461 bp  2190    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.213034  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1704  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1513 bp  2968    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1724  16S ribosomal RNA  99.74 
 
 		 1513 bp  2968    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69789  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0152  16S ribosomal RNA  93.99 
 
 		 1461 bp  2190    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2339  16S ribosomal RNA  93.49 
 
 		 1458 bp  2107    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.474601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0052  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1525 bp  533  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00180214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0016  16S ribosomal RNA  82.81 
 
 		 1525 bp  533  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0010  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1491 bp  440  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000216125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0028  16S ribosomal RNA  83.97 
 
 		 1491 bp  440  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0022269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0048  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1563 bp  436  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000038279  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0015  16S ribosomal RNA  81.58 
 
 		 1563 bp  436  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00605787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0011  16S ribosomal RNA  81.61 
 
 		 1548 bp  426  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0046  16S ribosomal RNA  81.61 
 
 		 1548 bp  426  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000312216  hitchhiker  0.000000195391 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0064  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1547 bp  414  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000356751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0069  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1547 bp  414  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000561178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0074  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1547 bp  414  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.18727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0059  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1547 bp  414  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00900498  hitchhiker  0.000470771 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0014  16S ribosomal RNA  81.47 
 
 		 1547 bp  414  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0215019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0013  16S ribosomal RNA  83.48 
 
 		 1495 bp  412  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000161102  normal  0.413867 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0043  16S ribosomal RNA  83.48 
 
 		 1534 bp  412  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000126976  normal  0.0100443 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0007  16S ribosomal RNA  83.31 
 
 		 1528 bp  408  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SA  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1473 bp  404  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00145569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_Mc16SB  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1473 bp  404  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000158044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0032  16S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 1550 bp  396  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0577345 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0043  16S ribosomal RNA  83.21 
 
 		 1550 bp  396  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5403  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1497 bp  394  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00231209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0082  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1537 bp  394  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000564092  normal  0.151299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0034  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1548 bp  394  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000185236  normal  0.225155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0811  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1497 bp  394  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00289135  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4846  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1497 bp  394  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0349073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0074  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1537 bp  394  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0008  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1548 bp  394  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  hitchhiker  0.000712257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08570  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1526 bp  394  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0337059  hitchhiker  0.00000000146404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55637  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1526 bp  394  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00734417  normal  0.40979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62090  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1526 bp  394  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.116263  normal  0.0197607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70910  16S ribosomal RNA  83.01 
 
 		 1526 bp  394  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.135781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0033  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1538 bp  392  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000378293  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0009  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1538 bp  392  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000955328  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0019  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1549 bp  392  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.163804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r0163  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1549 bp  392  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0633257  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1708  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1549 bp  392  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_r1835  16S ribosomal RNA  83.26 
 
 		 1549 bp  392  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.364981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55170  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1535 bp  389  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000502422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6153  16S ribosomal RNA  82.87 
 
 		 1497 bp  387  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55000  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1535 bp  389  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00013378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55030  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1535 bp  389  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00361459  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55060  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1535 bp  389  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000126948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55110  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1535 bp  389  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0208311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55140  16S ribosomal RNA  83.19 
 
 		 1535 bp  389  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000744342  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0039  16S ribosomal RNA  82.89 
 
 		 1545 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0012  16S ribosomal RNA  82.89 
 
 		 1550 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0012  16S ribosomal RNA  82.89 
 
 		 1545 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0039  16S ribosomal RNA  82.89 
 
 		 1550 bp  379  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0004  16S ribosomal RNA  82.67 
 
 		 1532 bp  373  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000674395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0009  16S ribosomal RNA  82.67 
 
 		 1532 bp  373  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0161785  normal  0.0703142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0011  16S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 1542 bp  363  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0038  16S ribosomal RNA  82.6 
 
 		 1542 bp  363  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106997  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0009  16S ribosomal RNA  80.39 
 
 		 1465 bp  359  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_rrsVIMSS1309392  16S ribosomal RNA  79.67 
 
 		 1465 bp  355  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0034  16S ribosomal RNA  80.48 
 
 		 1543 bp  355  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0312454  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0054  16S ribosomal RNA  80.48 
 
 		 1543 bp  355  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0043  16S ribosomal RNA  82.23 
 
 		 1526 bp  355  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000809065  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_rrsVIMSS1309398  16S ribosomal RNA  79.67 
 
 		 1498 bp  355  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0004  16S ribosomal RNA  79.79 
 
 		 1490 bp  351  4e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000000245039  normal  0.031985 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0052  16S ribosomal RNA  79.79 
 
 		 1490 bp  351  4e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000728584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_rrsVIMSS1309386  16S ribosomal RNA  79.59 
 
 		 1465 bp  347  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r01  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1518 bp  343  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.380261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r04  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1518 bp  343  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00569348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r07  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1518 bp  343  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r12  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1518 bp  343  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r15  16S ribosomal RNA  82.47 
 
 		 1518 bp  343  9e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.011004  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0339  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1512 bp  341  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R60  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1527 bp  341  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000806455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R94  16S ribosomal RNA  82.15 
 
 		 1527 bp  341  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000210152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>