More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0027 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0025  sodium/dicarboxylate symporter  97.18 
 
 
461 aa  855    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.181863  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0027  sodium/dicarboxylate symporter  100 
 
 
461 aa  919    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0052  sodium/dicarboxylate symporter  97.18 
 
 
461 aa  855    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  37.07 
 
 
435 aa  252  1e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  37.1 
 
 
435 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0856  sodium/dicarboxylate symporter  34.82 
 
 
471 aa  243  6e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02122  hypothetical protein  34.57 
 
 
457 aa  241  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1813  sodium/dicarboxylate symporter  34.3 
 
 
456 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0716204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003695  sodium/dicarboxylate symporter  33.48 
 
 
457 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1200  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4148  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000696352  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3988  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.04073e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3998  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000216588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4469  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000172174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4267  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.48 
 
 
464 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4377  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.26 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000178657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4324  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.26 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000495156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02783  hypothetical protein  32.11 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0876  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.26 
 
 
464 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000242898  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4358  sodium:dicarboxylate symporter family protein  33.26 
 
 
464 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4100  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 
464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0063  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.54 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00246087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2975  sodium:dicarboxylate symporter  33.04 
 
 
463 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0873777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2041  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 
463 aa  213  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0258833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0682  sodium:dicarboxylate symporter  32.67 
 
 
465 aa  209  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000682862  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0130  sodium/dicarboxylate symporter family protein  32.37 
 
 
457 aa  208  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000347492  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1851  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  31.26 
 
 
463 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0377279  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0324  sodium:dicarboxylate symporter  31.91 
 
 
455 aa  207  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1396  sodium:dicarboxylate symporter  31.48 
 
 
450 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000220299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1962  sodium:dicarboxylate symporter  31.52 
 
 
463 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152982  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2651  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.13 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.342663  normal  0.0129409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1685  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.13 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.24446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1462  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.61 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.726866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1795  sodium:dicarboxylate symporter  31.13 
 
 
463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0480  sodium:dicarboxylate symporter  29.98 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0200306  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01698  predicted transporter  31.4 
 
 
463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.770973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1913  sodium:dicarboxylate symporter  31.4 
 
 
463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0453037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2447  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family  31.4 
 
 
463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1810  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.4 
 
 
463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1903  sodium:dicarboxylate symporter  31.4 
 
 
463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.835053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01686  hypothetical protein  31.4 
 
 
463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.709568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1974  sodium:dicarboxylate symporter family  31.4 
 
 
463 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47375  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1417  sodium:dicarboxylate symporter family  31.26 
 
 
463 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977711  normal  0.0168529 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1950  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.18 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1660  Na+/H+-dicarboxylate symporter  33.26 
 
 
480 aa  199  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000719973  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1434  sodium:dicarboxylate symporter family  31.26 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5360  Sodium:dicarboxylate symporter  30.58 
 
 
463 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1449  sodium:dicarboxylate symporter family  31.26 
 
 
463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0981  sodium:dicarboxylate symporter  30.8 
 
 
463 aa  196  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.216579  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5183  sodium:dicarboxylate symporter  32.91 
 
 
463 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.337682  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2024  sodium:dicarboxylate symporter family protein  30.84 
 
 
463 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.546812  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0365  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter (DAACS) family protein  31.64 
 
 
451 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5131  sodium:dicarboxylate symporter  33.25 
 
 
463 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5004  sodium:dicarboxylate symporter  32.99 
 
 
463 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.143079  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1714  sodium:dicarboxylate symporter  31.4 
 
 
463 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.424207  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0334  sodium:dicarboxylate symporter  31.08 
 
 
463 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1900  sodium:dicarboxylate symporter  32.1 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0431  sodium:dicarboxylate symporter  32.21 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000163479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0442  sodium:dicarboxylate symporter  32.21 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000381157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2193  sodium:dicarboxylate symporter  32.18 
 
 
464 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1380  sodium:dicarboxylate symporter  30.07 
 
 
462 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379298  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1316  sodium:dicarboxylate symporter  29.89 
 
 
462 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.539428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2123  sodium:dicarboxylate symporter  31.16 
 
 
463 aa  187  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00153943  decreased coverage  0.000144884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  31.5 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  31.43 
 
 
441 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4249  sodium:dicarboxylate symporter  29.49 
 
 
462 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.688664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  28.81 
 
 
441 aa  179  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0754  transporter, dicarboxylate/amino acid:cation (na+ or H+) symporter (daacs) family protein  32.65 
 
 
463 aa  178  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.7297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 
419 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  32.22 
 
 
413 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 
419 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  31.87 
 
 
419 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  32.02 
 
 
419 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  30.21 
 
 
427 aa  176  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  32.11 
 
 
417 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  31.17 
 
 
417 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  28.89 
 
 
480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  34.04 
 
 
410 aa  173  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  30.45 
 
 
416 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  27.04 
 
 
442 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  31.61 
 
 
416 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.4 
 
 
437 aa  170  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  30.99 
 
 
419 aa  170  6e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl652  putative sodium-glutamate symporter  29.59 
 
 
585 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  32.4 
 
 
417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  32.57 
 
 
417 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  32.57 
 
 
417 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  29.58 
 
 
416 aa  167  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2153  sodium:dicarboxylate symporter  29.98 
 
 
470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  29.17 
 
 
500 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  28.97 
 
 
476 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  29.82 
 
 
426 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5150  sodium:dicarboxylate symporter  30.53 
 
 
520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  25.94 
 
 
444 aa  164  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  30 
 
 
439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  26.71 
 
 
436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 
440 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  27.42 
 
 
440 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1481  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family transporter  30.36 
 
 
448 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175987  hitchhiker  0.00000339976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1974  dicarboxylate/amino acid:cation (Na+ or H+) symporter family protein  30.43 
 
 
448 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  hitchhiker  0.000000330732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>