More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2978 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.233429  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.72 
 
 
240 aa  286  2e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.44 
 
 
236 aa  282  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.239235  normal  0.254296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.27 
 
 
244 aa  271  6e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134822  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.540844  normal  0.912393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
237 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.874533  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
237 aa  152  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.419442  unclonable  0.00000816972 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
234 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.114405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
233 aa  146  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0457321 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7169  short chain dehydrogenase  41.23 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000124511  unclonable  0.0000000105469 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
235 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0110746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1116  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1898  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.214682  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1577  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.63 
 
 
226 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.062462  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.29 
 
 
225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.379017  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
231 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2100  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
226 aa  123  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  33.07 
 
 
252 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  33.07 
 
 
252 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1895  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.43 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
232 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0110624  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.25 
 
 
246 aa  118  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0025  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.89 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7587  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115705  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.25 
 
 
246 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3439  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.32 
 
 
229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
244 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
245 aa  115  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0911  short chain dehydrogenase  38.08 
 
 
237 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
227 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70124  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
236 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.87 
 
 
262 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
261 aa  111  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
246 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3366  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00125321  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1534  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254503  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
262 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5484  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.485941 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3568  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4799  short chain dehydrogenase  38.75 
 
 
237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0583  putative short-chain dehydrogenase/reductase  35.44 
 
 
231 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00177948  normal  0.463308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
268 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
257 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1487  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
231 aa  108  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
275 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3589  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 
246 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.377487  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43336  Glucose 1-dehydrogenase peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase  33.2 
 
 
253 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
251 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
251 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4701  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 
237 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
254 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1406  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
251 aa  106  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
254 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
254 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
235 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.78 
 
 
248 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4179  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 
237 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0383999  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
255 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.03 
 
 
255 aa  105  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
264 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0960385  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
256 aa  105  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0825683  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  31.17 
 
 
255 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3805  short chain dehydrogenase  37.02 
 
 
237 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132901  hitchhiker  0.00346902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
256 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
255 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00276657  normal  0.102342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
273 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.19021  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
247 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.264326 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
254 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
280 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.86 
 
 
235 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.472868  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
240 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76943  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.84 
 
 
254 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0105  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.79 
 
 
248 aa  102  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.43 
 
 
246 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0877  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 
257 aa  102  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
251 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
255 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.583089  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0107  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 
258 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.1 
 
 
249 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  30.04 
 
 
245 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
248 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  32.93 
 
 
251 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
252 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  31.37 
 
 
265 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 
251 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 
253 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
245 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>