More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2859 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  68.25 
 
 
1335 aa  1061    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  71.47 
 
 
612 aa  900    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  100 
 
 
847 aa  1732    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  63.43 
 
 
1255 aa  973    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  72.05 
 
 
831 aa  1233    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  67.01 
 
 
1319 aa  1053    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  41.77 
 
 
797 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
791 aa  428  1e-118  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  50 
 
 
682 aa  422  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  50.89 
 
 
609 aa  422  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  48.26 
 
 
749 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  42.57 
 
 
551 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  41.77 
 
 
591 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  45.16 
 
 
558 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  48.11 
 
 
542 aa  393  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  47.48 
 
 
556 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  46.59 
 
 
547 aa  385  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
640 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  46.77 
 
 
654 aa  382  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  46.65 
 
 
549 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  46.41 
 
 
549 aa  372  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  36.79 
 
 
628 aa  362  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  38.54 
 
 
583 aa  345  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  36.75 
 
 
692 aa  333  6e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  43.11 
 
 
770 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  35.99 
 
 
991 aa  325  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  40.41 
 
 
545 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  37.95 
 
 
722 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  36.71 
 
 
510 aa  298  3e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  31.34 
 
 
519 aa  280  9e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  42.02 
 
 
618 aa  280  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.19 
 
 
671 aa  278  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  41.18 
 
 
604 aa  277  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  40.22 
 
 
617 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  40.16 
 
 
546 aa  270  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  40.16 
 
 
546 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  42.2 
 
 
622 aa  267  5.999999999999999e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  42.05 
 
 
610 aa  266  1e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  39.9 
 
 
546 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  38.78 
 
 
546 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  34.9 
 
 
557 aa  261  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  38.38 
 
 
557 aa  258  5e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  33.4 
 
 
547 aa  257  7e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  39.24 
 
 
557 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  33.02 
 
 
549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  42.57 
 
 
620 aa  254  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  34.82 
 
 
557 aa  251  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  36.36 
 
 
512 aa  245  3e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  36.73 
 
 
543 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.61 
 
 
491 aa  243  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  37.03 
 
 
559 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
492 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.03 
 
 
492 aa  238  4e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
513 aa  237  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  35.01 
 
 
577 aa  223  9e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  32.33 
 
 
572 aa  215  2.9999999999999995e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  29.49 
 
 
489 aa  212  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  34.09 
 
 
548 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  34.5 
 
 
311 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  32.38 
 
 
552 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
552 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  32.55 
 
 
544 aa  195  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  29.77 
 
 
553 aa  191  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  29.77 
 
 
553 aa  191  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  29.77 
 
 
553 aa  191  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  29.77 
 
 
553 aa  191  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  32.14 
 
 
491 aa  164  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
440 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  30.54 
 
 
473 aa  162  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.73 
 
 
476 aa  162  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.49 
 
 
515 aa  161  5e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.92 
 
 
463 aa  160  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  30.7 
 
 
453 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
460 aa  159  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  31.85 
 
 
452 aa  159  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.05 
 
 
454 aa  157  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  31.85 
 
 
450 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.28 
 
 
438 aa  154  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  30.59 
 
 
438 aa  154  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  33.53 
 
 
477 aa  154  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  29.75 
 
 
440 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  30.81 
 
 
444 aa  153  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  34.06 
 
 
454 aa  154  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
449 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  31.75 
 
 
455 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  36.72 
 
 
449 aa  153  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  35.38 
 
 
472 aa  152  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  32.34 
 
 
634 aa  152  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  32.08 
 
 
446 aa  152  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  32.55 
 
 
442 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  31.47 
 
 
447 aa  151  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  31.76 
 
 
447 aa  151  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  31.47 
 
 
487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  30.07 
 
 
408 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  30.32 
 
 
462 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  32.38 
 
 
423 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  29.57 
 
 
451 aa  148  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  29.86 
 
 
457 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  36.43 
 
 
452 aa  149  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  30.88 
 
 
450 aa  149  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>