86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2817 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2817  DoxX family protein  100 
 
 
138 aa  270  5.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3707  DoxX family protein  57.36 
 
 
149 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2564  DoxX family protein  50.39 
 
 
137 aa  120  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2251  DoxX family protein  52.63 
 
 
146 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.431284  normal  0.139813 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1422  DoxX family protein  63.33 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1365  DoxX family protein  44.44 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0662293  normal  0.0953632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2379  DoxX family protein  43.27 
 
 
121 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.618537  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2877  DoxX family protein  35.78 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2221  DoxX family protein  38.32 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2081  DoxX family protein  33.85 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3348  DoxX  33.07 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0716703  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0014  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.133834  normal  0.506679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4045  DoxX family protein  32.77 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0512358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2385  DoxX family protein  30.77 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0905931  normal  0.641291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3132  DoxX family protein  34.21 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4295  hypothetical protein  35.34 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.023682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3057  DoxX family protein  29.51 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2151  transporter  32.48 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.447191  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5848  DoxX family protein  29.27 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6086  DoxX family protein  29.27 
 
 
137 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0786046  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3837  SURF4 domain-containing protein  30.16 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  0.973533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3122  DoxX family protein  30.7 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.461418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4121  DoxX  30 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.575367  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5222  DoxX family protein  30.16 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1934  DoxX family protein  30.16 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.467271  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2930  DoxX family protein  28.46 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0630  DoxX family protein  32.32 
 
 
140 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.470761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3329  DoxX family protein  38.46 
 
 
134 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2298  DoxX family protein  31.97 
 
 
135 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000018841  hitchhiker  0.00171371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1209  hypothetical protein  27.27 
 
 
137 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177047  normal  0.393618 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5841  DoxX  30.43 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1200  DoxX  31.86 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3973  DoxX family protein  31.75 
 
 
135 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2087  DoxX  28.7 
 
 
119 aa  50.4  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2574  DoxX  34.41 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.404201  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1386  DoxX family protein  28.21 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.42391  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1517  DoxX family protein  28.95 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000129276  hitchhiker  0.00151008 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4094  hypothetical protein  30.25 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.887917  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1542  DoxX  29.17 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.294668  normal  0.482647 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2900  DoxX  29.69 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290679  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1454  DoxX family protein  29.03 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3623  DoxX family protein  29.46 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.0330424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2327  DoxX  29.41 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0405527  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5400  DoxX family protein  24.22 
 
 
137 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0358694  normal  0.0708806 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6046  DoxX family protein  29.37 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.392213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0701  DoxX family protein  29.17 
 
 
128 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1172  hypothetical membrane spanning protein  32.97 
 
 
142 aa  47  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2382  DoxX family protein  42.57 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3737  DoxX family protein  28.68 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0862  DoxX family membrane protein  31.87 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3428  DoxX family protein  28.68 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.315995  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2500  hypothetical protein  26.45 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.831259  normal  0.0755951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0354  DoxX  31.58 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0302  DoxX family protein  31.2 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0320339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1140  hypothetical protein  31.03 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1718  DoxX family protein  29.91 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4104  DoxX family protein  41.23 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434829  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1637  DoxX  29.41 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00123238  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2360  DoxX family protein  27.27 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.233009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1932  DoxX family protein  28.57 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.486729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3552  DoxX family protein  31.82 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.583897  normal  0.164311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3205  DoxX family protein  28.46 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1387  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0860  DoxX  25.22 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2035  normal  0.169459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2902  DoxX family protein  27.36 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0568871  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18970  predicted membrane protein  29.91 
 
 
236 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.129095  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3474  DoxX family protein  32.81 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.418038 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1413  DoxD-like family protein  26.09 
 
 
182 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6117  DoxX family protein  29.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5753  DoxX  29.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6600  DoxX family protein  29.41 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4810  DoxX  31.3 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2498  DoxX  25.95 
 
 
149 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7619  DoxX  32.04 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4661  DoxX family protein  35.79 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526141  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0867  membrane protein yphA  31.75 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4441  DoxX family protein  33.05 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.147857  normal  0.924554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4554  DoxX family protein  31.71 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1986  DoxX family protein  29.36 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2730  DoxX family protein  33.33 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368422  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1295  DoxX family membrane protein  29.35 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174807  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4096  DoxX family protein  28.26 
 
 
174 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0554855  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3268  DoxX family protein  25.71 
 
 
198 aa  40.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4440  DoxX family protein  28.26 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4935  DoxX family protein  33.04 
 
 
136 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319097 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18830  predicted membrane protein  32.5 
 
 
226 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>