More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2743 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  100 
 
 		 349 aa  707    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  79.94 
 
 		 349 aa  553  1e-156  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  68.79 
 
 		 361 aa  479  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  69.12 
 
 		 365 aa  464  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  67.81 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  43.84 
 
 		 365 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  45.04 
 
 		 384 aa  280  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  40.4 
 
 		 363 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  42.09 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  39.44 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  39.71 
 
 		 369 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  40.4 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  37.13 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  36.86 
 
 		 384 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  38.65 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  36.59 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  35.96 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  35.99 
 
 		 390 aa  238  8e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.33 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.67 
 
 		 403 aa  192  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.07 
 
 		 411 aa  162  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.59 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.34 
 
 		 468 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.8 
 
 		 514 aa  115  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.99 
 
 		 498 aa  113  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.17 
 
 		 499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.55 
 
 		 500 aa  109  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.68 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.82 
 
 		 478 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  28.48 
 
 		 546 aa  106  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  28.26 
 
 		 532 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  27.76 
 
 		 572 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.35 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  27.19 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  27.47 
 
 		 515 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  27.86 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  26.53 
 
 		 460 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2315  glutamate decarboxylase  25.92 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.04 
 
 		 494 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.56 
 
 		 472 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.39 
 
 		 548 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2029  glutamate decarboxylase  26.11 
 
 		 466 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.31 
 
 		 474 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.73 
 
 		 554 aa  98.2  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.4 
 
 		 546 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.67 
 
 		 425 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.29 
 
 		 546 aa  96.7  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.49 
 
 		 552 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.66 
 
 		 550 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.09 
 
 		 498 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.02 
 
 		 549 aa  94.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.39 
 
 		 549 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.39 
 
 		 549 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.02 
 
 		 549 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.39 
 
 		 549 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0045  glutamate decarboxylase  28.2 
 
 		 468 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  29.07 
 
 		 548 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  29.67 
 
 		 473 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.55 
 
 		 551 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  30.79 
 
 		 473 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3826  glutamate decarboxylase  27.65 
 
 		 461 aa  92.8  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0934  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.06 
 
 		 466 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000218274  decreased coverage  0.000132275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  33.76 
 
 		 483 aa  92.4  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0181  glutamate decarboxylase  29.01 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  29.45 
 
 		 543 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  30.66 
 
 		 533 aa  91.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40180  Glutamate decarboxylase (GAD) (ERT D1)  24.74 
 
 		 569 aa  90.9  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.95 
 
 		 789 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3467  glutamate decarboxylase  29.94 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.43113  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.29 
 
 		 549 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.67 
 
 		 549 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.67 
 
 		 549 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2953  glutamate decarboxylase  26.17 
 
 		 464 aa  89.7  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.78 
 
 		 529 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.18 
 
 		 547 aa  89.7  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5339  glutamate decarboxylase  26.02 
 
 		 468 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.01 
 
 		 550 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2761  sphingosine-1-phosphate lyase  28.53 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1143  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  28.53 
 
 		 473 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  31.88 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07278  glutamate decarboxylase (Eurofung)  25.76 
 
 		 521 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.8 
 
 		 500 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1074  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.45 
 
 		 551 aa  87.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.433316 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.94 
 
 		 560 aa  87.4  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02100  histidine decarboxylase  25.18 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1172  glutamate decarboxylase  26.41 
 
 		 461 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615591  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0551  glutamate decarboxylase  27.5 
 
 		 461 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1145  glutamate decarboxylase  26.41 
 
 		 461 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2918  sphingosine-1-phosphate lyase  28.52 
 
 		 485 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.216588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1162  glutamate decarboxylase  26.41 
 
 		 461 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.824661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.64 
 
 		 511 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18041  glutamate decarboxylase  28.92 
 
 		 479 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.171895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3171  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.6 
 
 		 505 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.902274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  30.29 
 
 		 472 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.65 
 
 		 611 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  28.21 
 
 		 473 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  28.21 
 
 		 473 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  29.82 
 
 		 548 aa  85.9  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.11 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>