More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2731 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0259  DNA topoisomerase type IA central domain protein  66.06 
 
 		 864 aa  1135    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2410  DNA topoisomerase I  47.79 
 
 		 771 aa  636    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.11035 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2731  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 844 aa  1707    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.186723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3010  DNA topoisomerase I  76.57 
 
 		 863 aa  1322    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1458  DNA topoisomerase I  68.84 
 
 		 827 aa  1144    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2461  DNA topoisomerase  68.72 
 
 		 843 aa  1180    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0095  DNA topoisomerase I  47.42 
 
 		 743 aa  633  1e-180  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000317173  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0595  DNA topoisomerase I  46.6 
 
 		 744 aa  634  1e-180  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1011  DNA topoisomerase  48.01 
 
 		 931 aa  627  1e-178  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783808  normal  0.0479859 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0770  DNA topoisomerase  48.44 
 
 		 931 aa  619  1e-175  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112956  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0859  DNA topoisomerase  47.41 
 
 		 942 aa  601  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1299  DNA topoisomerase type IA central domain protein  46.22 
 
 		 938 aa  587  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.596273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1964  DNA topoisomerase I  45.77 
 
 		 702 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1139  hypothetical protein  45.12 
 
 		 935 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1093  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.51 
 
 		 837 aa  535  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0335  DNA topoisomerase I  38.5 
 
 		 747 aa  531  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1139  DNA topoisomerase type IA central domain protein  37.89 
 
 		 849 aa  526  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.395203 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23450  topoisomerase IA  36.43 
 
 		 837 aa  524  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000217154  decreased coverage  0.0000000285044 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09220  topoisomerase IA  36.91 
 
 		 834 aa  510  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.143894  normal  0.0154062 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0705  DNA topoisomerase  31.57 
 
 		 780 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2128  DNA topoisomerase, type I  30.95 
 
 		 855 aa  376  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.572238 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0158  DNA topoisomerase I  30.69 
 
 		 817 aa  348  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.087887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0781  DNA topoisomerase I  30.98 
 
 		 812 aa  347  5e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1699  DNA topoisomerase I  29.22 
 
 		 814 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0203  DNA topoisomerase I  29.19 
 
 		 814 aa  338  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.698596 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0026  DNA topoisomerase I  28.4 
 
 		 853 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1735  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  34.48 
 
 		 604 aa  301  5e-80  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.718005  hitchhiker  0.000823973 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0885  DNA topoisomerase  33.22 
 
 		 631 aa  283  1e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0843416  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1115  DNA topoisomerase  34.32 
 
 		 596 aa  282  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1359  DNA topoisomerase  31.54 
 
 		 602 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.013738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0392  DNA topoisomerase  31.15 
 
 		 604 aa  270  7e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.225119  normal  0.175863 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0109  DNA topoisomerase type IA central domain-containing protein  29.48 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000681889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.05 
 
 		 691 aa  260  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  30.79 
 
 		 868 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 760 aa  257  8e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 		 869 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  30.73 
 
 		 869 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 		 869 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 		 869 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  29.44 
 
 		 768 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  30.16 
 
 		 868 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  29.97 
 
 		 868 aa  253  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  31.29 
 
 		 868 aa  252  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.87 
 
 		 743 aa  251  3e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1332  DNA topoisomerase I  31.07 
 
 		 876 aa  249  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000656424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  29.93 
 
 		 870 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 876 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 747 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  29.71 
 
 		 697 aa  245  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  30.59 
 
 		 876 aa  246  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  30.11 
 
 		 693 aa  245  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  30.03 
 
 		 876 aa  245  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 868 aa  244  5e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  31.34 
 
 		 797 aa  244  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  29.46 
 
 		 869 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.17 
 
 		 689 aa  242  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 696 aa  240  6.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2316  DNA topoisomerase I  29.38 
 
 		 866 aa  240  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.105291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1197  DNA topoisomerase I  30.49 
 
 		 899 aa  240  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.77 
 
 		 751 aa  239  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  28.51 
 
 		 765 aa  238  3e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  29.12 
 
 		 841 aa  238  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 836 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 702 aa  237  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 851 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  29.27 
 
 		 879 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  29.18 
 
 		 867 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 851 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  28.11 
 
 		 693 aa  236  1.0000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1971  DNA topoisomerase I  29.85 
 
 		 883 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819086  normal  0.697086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01250  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.856005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2375  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2354  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.01053  unclonable  0.0000000472675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01260  hypothetical protein  29.54 
 
 		 865 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.742047  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.87 
 
 		 789 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2015  DNA topoisomerase I  29.12 
 
 		 866 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00844458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  31.33 
 
 		 852 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1383  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  236  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1498  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 865 aa  235  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1906  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176274  hitchhiker  0.000000000000101765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2657  DNA topoisomerase I  29.24 
 
 		 865 aa  234  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000104499  unclonable  0.0000000870588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0466  DNA topoisomerase III  28.47 
 
 		 670 aa  234  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  29.4 
 
 		 865 aa  234  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1474  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 865 aa  234  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00320061  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1164  DNA topoisomerase I  29.09 
 
 		 879 aa  234  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144967  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2841  DNA topoisomerase I  29.36 
 
 		 889 aa  234  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.598505  hitchhiker  0.00000400834 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  29.44 
 
 		 886 aa  233  8.000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  29.52 
 
 		 758 aa  233  9e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  27.55 
 
 		 793 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  28.24 
 
 		 765 aa  233  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  30.25 
 
 		 697 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 780 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  29.23 
 
 		 836 aa  233  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 831 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 831 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  27.38 
 
 		 691 aa  231  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  27.38 
 
 		 691 aa  231  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  27.51 
 
 		 746 aa  231  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  29.41 
 
 		 865 aa  230  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  29.21 
 
 		 898 aa  230  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>