More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2712 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2712  cysteine synthase  100 
 
 
304 aa  598  1e-170  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.470857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  54.02 
 
 
311 aa  315  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  52.27 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  57.93 
 
 
310 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  57.79 
 
 
309 aa  311  7.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  57.93 
 
 
309 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  57.93 
 
 
309 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3364  cysteine synthase A  52.61 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000830673  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0889  cysteine synthase A  48.68 
 
 
304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  49.67 
 
 
304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  57.61 
 
 
309 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  55.48 
 
 
309 aa  305  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0154  cysteine synthase K/M/A  51.32 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054726  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  57 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  58.5 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1337  cysteine synthase A  59.2 
 
 
310 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.241539  normal  0.869018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  55.81 
 
 
311 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  56.49 
 
 
308 aa  302  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3256  cysteine synthase A  55.66 
 
 
309 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0902  cysteine synthase A  50.5 
 
 
299 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000000036612  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  53.59 
 
 
311 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  57 
 
 
311 aa  300  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  50.49 
 
 
307 aa  299  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  54.4 
 
 
317 aa  298  5e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  53.85 
 
 
320 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  53.29 
 
 
308 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0990  cysteine synthase A  49.83 
 
 
299 aa  296  3e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  hitchhiker  0.0058381  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  53.53 
 
 
330 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  54.19 
 
 
310 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  57.28 
 
 
309 aa  296  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  55.84 
 
 
310 aa  295  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  55.23 
 
 
308 aa  295  6e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  53.07 
 
 
318 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  52.41 
 
 
310 aa  294  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2776  cysteine synthase A  57.19 
 
 
312 aa  294  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  53.92 
 
 
310 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  53.75 
 
 
309 aa  294  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  51.92 
 
 
320 aa  293  2e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  52.55 
 
 
324 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  54.87 
 
 
317 aa  293  3e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1332  cysteine synthase A  52.81 
 
 
309 aa  293  3e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000281475  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  51.83 
 
 
320 aa  292  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  52.4 
 
 
317 aa  292  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  51.16 
 
 
320 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  55.7 
 
 
327 aa  290  2e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  55.16 
 
 
311 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0783  cysteine synthase A  58.28 
 
 
315 aa  289  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  56.54 
 
 
309 aa  289  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0152  cysteine synthase  50.83 
 
 
310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  51.92 
 
 
313 aa  288  7e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  52.56 
 
 
319 aa  288  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  54.84 
 
 
311 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0548  cysteine synthase A  49.5 
 
 
310 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0535  cysteine synthase A  49.5 
 
 
310 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.775182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  50.81 
 
 
311 aa  285  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  52.88 
 
 
320 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23060  cysteine synthase A  51.96 
 
 
305 aa  286  4e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000228532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  54.61 
 
 
306 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  55.81 
 
 
311 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  55.02 
 
 
308 aa  285  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  57.28 
 
 
310 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3068  cysteine synthase A  50.96 
 
 
316 aa  285  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145676  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  53.87 
 
 
323 aa  285  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  55.66 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  57.14 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  52.09 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1832  cysteine synthase A  50 
 
 
317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.118091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  55.37 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0369  cysteine synthase  48.08 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.425105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  51.45 
 
 
320 aa  281  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  50.49 
 
 
311 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  52.63 
 
 
309 aa  281  9e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  47.54 
 
 
312 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  57.33 
 
 
308 aa  281  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  50 
 
 
320 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  56.82 
 
 
311 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  54.55 
 
 
309 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  55.81 
 
 
322 aa  280  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  52.77 
 
 
309 aa  280  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2365  cysteine synthase  52.4 
 
 
322 aa  279  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  54.49 
 
 
320 aa  278  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  56.03 
 
 
309 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  55.52 
 
 
328 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  50.16 
 
 
317 aa  277  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0484  cysteine synthase A  50.16 
 
 
324 aa  277  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.261567  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  53.57 
 
 
311 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4757  cysteine synthase A  52.6 
 
 
328 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.157844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  47.06 
 
 
312 aa  277  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  54.87 
 
 
311 aa  276  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12320  cysteine synthase  52.6 
 
 
309 aa  275  5e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.154234  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  54.22 
 
 
319 aa  275  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0063  cysteine synthase A  53.77 
 
 
307 aa  275  6e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1720  cysteine synthase  51.16 
 
 
302 aa  275  8e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0556189 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  51.75 
 
 
316 aa  275  9e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  52.92 
 
 
322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004156  cysteine synthase  51.77 
 
 
322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000187133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  52.1 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  52.77 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2356  cysteine synthase A  51.77 
 
 
322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  52.94 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>