More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2689 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2689  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 510 aa  1019    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1322  preprotein translocase subunit SecD  53.49 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.776168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0744  SecD/SecF/SecDF export membrane protein  45.98 
 
 		 537 aa  428  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1964  preprotein translocase subunit SecD  48.38 
 
 		 529 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94592  normal  0.207837 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2707  preprotein translocase subunit SecD  45.01 
 
 		 549 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1023  preprotein translocase subunit SecD  32.31 
 
 		 507 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3176  preprotein translocase subunit SecD  30.33 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1797  preprotein translocase subunit SecD  31.08 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0601908  normal  0.730674 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1656  preprotein translocase subunit SecD  29.25 
 
 		 485 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00710078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0851  preprotein translocase subunit SecD  28.33 
 
 		 566 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0895  preprotein translocase subunit SecD  28.08 
 
 		 558 aa  161  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.433485  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0836  preprotein translocase subunit SecD  33.24 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0280  preprotein translocase subunit SecD  31.34 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1017  preprotein translocase subunit SecD  40.1 
 
 		 391 aa  150  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.562711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0771  preprotein translocase subunit SecD  39.09 
 
 		 388 aa  150  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0052  preprotein translocase subunit SecD  39.59 
 
 		 388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1147  preprotein translocase subunit SecD  39.09 
 
 		 388 aa  147  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1987  preprotein translocase subunit SecD  38.81 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000381338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  27.46 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1340  protein-export membrane protein SecD  37.64 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  24.51 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  28 
 
 		 531 aa  73.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  29.91 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  28.85 
 
 		 638 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  25.75 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0672  preprotein translocase subunit SecD  25.3 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  27.94 
 
 		 607 aa  70.5  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1240  protein translocase subunit  31.91 
 
 		 622 aa  69.7  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00253338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  30.22 
 
 		 531 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1905  protein-export membrane protein SecD  31.08 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  31.89 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  29.9 
 
 		 595 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1291  protein-export membrane protein SecD  31.91 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.00000000000000635694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  32.43 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  28.15 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  27.96 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16221  preprotein translocase subunit SecD  26.44 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0067  protein-export membrane protein SecD  30.99 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  27.24 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  30 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  24.44 
 
 		 525 aa  66.6  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  27.59 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3399  protein-export membrane protein SecF  28.04 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00684412  decreased coverage  0.000027343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12260  protein-export membrane protein SecD  27.66 
 
 		 403 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000764404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  32.43 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  26.96 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0067  protein-export membrane protein SecD  30.99 
 
 		 465 aa  65.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  26.42 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3070  protein-export membrane protein SecF  26.79 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0587358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  26.42 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3289  preprotein translocase subunit SecD  29.1 
 
 		 604 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.5 
 
 		 853 aa  64.7  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  29.12 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  29.61 
 
 		 512 aa  64.7  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  30.99 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1021  preprotein translocase subunit SecD  29.1 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  30.32 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  29.35 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3249  preprotein translocase subunit SecF  27.71 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.015855  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1118  preprotein translocase subunit SecF  27.71 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.377111  hitchhiker  0.000000000101209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3291  preprotein translocase subunit SecF  27.71 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  25.77 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3427  preprotein translocase subunit SecF  27.71 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000133978  decreased coverage  0.000105765 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0282  preprotein translocase subunit SecD  27.11 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.621699  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  29.17 
 
 		 607 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3095  preprotein translocase subunit SecD  32.81 
 
 		 604 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  26.4 
 
 		 486 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  26.24 
 
 		 1029 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  29.13 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  28.26 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  27.76 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1081  preprotein translocase subunit SecF  27.27 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121562  normal  0.1541 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09521  preprotein translocase subunit SecD  27.11 
 
 		 496 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.1601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  22.7 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3571  protein-export membrane protein SecF  26.67 
 
 		 314 aa  62  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00137282  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2844  preprotein translocase subunit SecF  26.67 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000056416  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1194  preprotein translocase subunit SecF  26.67 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  30.35 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  28.08 
 
 		 489 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  27 
 
 		 532 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  31.03 
 
 		 991 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  24.35 
 
 		 532 aa  62  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1028  preprotein translocase subunit SecD  31.1 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.016566 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2835  preprotein translocase subunit SecD  27.51 
 
 		 616 aa  60.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0599  protein-export membrane protein SecD  28.57 
 
 		 612 aa  60.8  0.00000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  27.34 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  28.19 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  26.43 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0980  preprotein translocase subunit SecF  29.17 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00161117  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  28.14 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  27.27 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  26 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  27.69 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1016  preprotein translocase subunit SecF  26.06 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0271563  hitchhiker  0.00537871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  25.27 
 
 		 535 aa  60.1  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  28.71 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  27.94 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1020  preprotein translocase subunit SecF  26.06 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00412183  hitchhiker  0.000205706 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  29.32 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  29.32 
 
 		 615 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>