179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2606 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
150 aa  291  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  32.37 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  29.93 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.99 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  31.62 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  34.04 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  34.04 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  29.71 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  31.76 
 
 
195 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  30.56 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  32.56 
 
 
176 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  30.94 
 
 
202 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  30.94 
 
 
202 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  30.94 
 
 
202 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  30.94 
 
 
202 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  30.94 
 
 
202 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  25.85 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  28.38 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 
179 aa  57.4  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  30.06 
 
 
176 aa  57.4  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  30.15 
 
 
170 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 
160 aa  57  0.00000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  32.33 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.25 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  31.51 
 
 
206 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  31.97 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  33.09 
 
 
147 aa  55.1  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  32.84 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  33.6 
 
 
175 aa  55.1  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  30.08 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  30.88 
 
 
206 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.97 
 
 
1053 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.72 
 
 
182 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  30.15 
 
 
206 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  34.87 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.07 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  31.43 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  31.61 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  29.01 
 
 
209 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  29.93 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.22 
 
 
222 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  29.93 
 
 
214 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  27.4 
 
 
166 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  28.68 
 
 
221 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.67 
 
 
167 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  28.47 
 
 
224 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  28.76 
 
 
158 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  31.71 
 
 
186 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  28.19 
 
 
195 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  45.59 
 
 
157 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  35.29 
 
 
271 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  29.63 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 
173 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  31.29 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  30.56 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  30.15 
 
 
201 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  21.19 
 
 
190 aa  50.8  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  24.63 
 
 
137 aa  50.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 
257 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  40 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  30.37 
 
 
198 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  36.36 
 
 
159 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  43.48 
 
 
188 aa  50.4  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  32 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  28.86 
 
 
223 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  32.43 
 
 
166 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  25.52 
 
 
163 aa  50.4  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  38.03 
 
 
158 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 
165 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  30.88 
 
 
191 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  30.28 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  30.37 
 
 
198 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  31.21 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  29.03 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  26.53 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  26.43 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  28.77 
 
 
159 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.37 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  30.61 
 
 
218 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  30.56 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  36.84 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  30.37 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  30.37 
 
 
198 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  30.37 
 
 
198 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  30.28 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  30.28 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  27.48 
 
 
203 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  28.37 
 
 
151 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  29.25 
 
 
208 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  29.03 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  30.28 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  30.28 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  30.28 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0289  hydrogenase maturation protease  26.11 
 
 
189 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>