274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2514 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  90.2 
 
 		 259 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  88.61 
 
 		 269 aa  368  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  88.12 
 
 		 263 aa  368  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  87.37 
 
 		 268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  68.06 
 
 		 206 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  61.22 
 
 		 214 aa  274  9e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  62.96 
 
 		 203 aa  268  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  62.5 
 
 		 205 aa  267  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  52.05 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  60.32 
 
 		 202 aa  264  8.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  61.38 
 
 		 202 aa  264  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  55.05 
 
 		 199 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  59.26 
 
 		 202 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  54.44 
 
 		 221 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  54.44 
 
 		 221 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  53.89 
 
 		 221 aa  222  6e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  54.44 
 
 		 220 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  55.37 
 
 		 220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  52.04 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  51.52 
 
 		 214 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  53.41 
 
 		 225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  45.65 
 
 		 207 aa  187  2e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  47.49 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  46.2 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  44.02 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  47.62 
 
 		 207 aa  178  9e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  41.34 
 
 		 215 aa  156  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  44.71 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  43.93 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  40.12 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  39.53 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.71 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0648  ribosomal protein S2  22.87 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.154128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1199  30S ribosomal protein S2  26.22 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0195465  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  25.94 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1832  30S ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000152831  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0026  30S ribosomal protein S2  24.73 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0684  30S ribosomal protein S2  23.58 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000550841  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  24.44 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  23.81 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  20.72 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  22.52 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  21.17 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0164  30S ribosomal protein S2  22.81 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000119331  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0975  SSU ribosomal protein S2P  24.68 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000199149  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  21.17 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2347  30S ribosomal protein S2  21.62 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  26.07 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1049  30S ribosomal protein S2  23.56 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0905437  normal  0.331293 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0166  30S ribosomal protein S2  22.81 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  21.83 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  25.97 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  24.03 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1966  ribosomal protein S2  22.67 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  21.83 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  24.64 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  21.43 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0957  ribosomal protein S2  23.95 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0840  30S ribosomal protein S2  24.64 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00899072  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0926  30S ribosomal protein S2  23.11 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  22.97 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  23.98 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  23.61 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2306  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.690808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1153  30S ribosomal protein S2  21.74 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  24.22 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3517  ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 420 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  25.35 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  24.12 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  22.37 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  23.98 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1780  30S ribosomal protein S2  21.43 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000158872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2578  30S ribosomal protein S2  22.27 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  22.52 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2530  30S ribosomal protein S2  24.05 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.963698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0371  30S ribosomal protein S2  23.72 
 
 		 291 aa  54.3  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1960  30S ribosomal protein S2  23.81 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  22.81 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  22.17 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0474  30S ribosomal protein S2  23.32 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3528  30S ribosomal protein S2  22.27 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.421739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  21.88 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  23.18 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  21.17 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0050  30S ribosomal protein S2  25.11 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0359  30S ribosomal protein S2  24.19 
 
 		 245 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  21.74 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4883  30S ribosomal protein S2  21.83 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1848  ribosomal protein S2  22.17 
 
 		 288 aa  52.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0363359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  20.75 
 
 		 244 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  22.07 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0377  30S ribosomal protein S2  23.66 
 
 		 245 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000247942  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2733  ribosomal protein S2  23.42 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36757e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07650  ribosomal protein S2  22.17 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_321  ribosomal protein S2  23.66 
 
 		 245 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000206427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  22.64 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0377  30S ribosomal protein S2  22.27 
 
 		 281 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1520  ribosomal protein S2  24.89 
 
 		 289 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0295  30S ribosomal protein S2  22.98 
 
 		 343 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0422466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>