28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2505 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  100 
 
 
92 aa  177  3e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  86.81 
 
 
92 aa  156  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  64.13 
 
 
92 aa  124  4e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  68.82 
 
 
93 aa  115  2e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  67.74 
 
 
93 aa  112  1e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.82 
 
 
89 aa  72  3e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0004  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.82 
 
 
90 aa  70.1  1e-11  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000181188  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  45.95 
 
 
113 aa  65.9  2e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  38.64 
 
 
103 aa  64.3  6e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35.29 
 
 
89 aa  63.5  9e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  34.12 
 
 
89 aa  62.8  1e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0432  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  31.76 
 
 
89 aa  58.2  4e-08  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00986722  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.5 
 
 
101 aa  57.8  5e-08  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.473363  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0367  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.44 
 
 
100 aa  57  9e-08  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1413  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  37.04 
 
 
87 aa  56.6  1e-07  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  36.11 
 
 
104 aa  55.1  3e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60739  signal recognition particle subunit  30.85 
 
 
276 aa  54.7  4e-07  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.022276  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  39.13 
 
 
257 aa  55.1  4e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  38.03 
 
 
355 aa  52.8  2e-06  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1514  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  37.93 
 
 
90 aa  51.6  3e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.917345  normal  0.846669 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44439  predicted protein  34.44 
 
 
210 aa  51.2  5e-06  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1731  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  37.14 
 
 
97 aa  48.5  3e-05  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.583276 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10601  predicted protein  36.84 
 
 
105 aa  47  9e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0576  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  33.33 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00280682 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1566  ribonucleoprotein complex SRP, SRP19 component  35.85 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0471  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.89 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0373645  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0334  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.22 
 
 
90 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.725093 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1746  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.69 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.100961  hitchhiker  0.00245079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>