More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2489 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
243 aa  501  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  54.15 
 
 
249 aa  257  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  40.35 
 
 
256 aa  151  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  35.52 
 
 
408 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.18 
 
 
267 aa  126  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  32.02 
 
 
370 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.68 
 
 
267 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.63 
 
 
270 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.13 
 
 
367 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.78 
 
 
270 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.19 
 
 
267 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  33.68 
 
 
399 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  30.65 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.98 
 
 
362 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  36.65 
 
 
318 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.17 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  35.96 
 
 
405 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  31.8 
 
 
321 aa  118  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  32.57 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  35.39 
 
 
344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  38.01 
 
 
359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  29.34 
 
 
320 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  29.34 
 
 
320 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  33.5 
 
 
275 aa  115  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  30.29 
 
 
329 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  35.23 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  33 
 
 
343 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.68 
 
 
321 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  34.25 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  32.47 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  26.85 
 
 
377 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.58 
 
 
355 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  28.88 
 
 
524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  31.67 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  34.05 
 
 
288 aa  113  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 
324 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30 
 
 
324 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  37.43 
 
 
362 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  27.37 
 
 
339 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  31.58 
 
 
316 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  34.62 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.2 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  33.16 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  37.43 
 
 
362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  34.59 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.99 
 
 
330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.51 
 
 
301 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.18 
 
 
267 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.53 
 
 
274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  45.05 
 
 
351 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  28.08 
 
 
281 aa  109  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  32.76 
 
 
351 aa  109  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 
513 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.98 
 
 
311 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  27.73 
 
 
328 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 
521 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  33.15 
 
 
351 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  28.17 
 
 
336 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  33.93 
 
 
330 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  28.02 
 
 
528 aa  107  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  34.36 
 
 
342 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  27.39 
 
 
304 aa  106  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0264  cytochrome c oxidase, subunit II  34.17 
 
 
343 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3770  cytochrome c oxidase subunit II  31.8 
 
 
349 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  31.49 
 
 
320 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  31.87 
 
 
426 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  41.04 
 
 
355 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2646  cytochrome c oxidase subunit II  31.28 
 
 
349 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0991495  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  28.64 
 
 
279 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  31.69 
 
 
350 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.64 
 
 
279 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  27.67 
 
 
279 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1193  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
349 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  32.46 
 
 
290 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  27.07 
 
 
518 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  26.72 
 
 
524 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
349 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 
518 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 
513 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3856  cytochrome c oxidase subunit II  32.72 
 
 
349 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.15254  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3687  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
349 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3704  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
349 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 
298 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.69 
 
 
350 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  36.84 
 
 
310 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  31.69 
 
 
350 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4154  cytochrome c oxidase subunit II  32.72 
 
 
349 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4062  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
349 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3959  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
349 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  27.51 
 
 
284 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  31.98 
 
 
273 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4046  cytochrome c oxidase, subunit II  32.72 
 
 
349 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  27.31 
 
 
518 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  27.07 
 
 
518 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  36.26 
 
 
313 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  26.41 
 
 
513 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  27.94 
 
 
292 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  28.18 
 
 
279 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>