More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2434 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
111 aa  224  3e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  51.61 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0013  regulatory protein, ArsR  44.05 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0817  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  44.78 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  46.48 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  46.97 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0684  transcriptional regulator, ArsR family  39.29 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2373  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000354964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6661  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.69 
 
 
93 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.500493  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2322  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 
111 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  46.15 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
103 aa  67.8  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0671  transcriptional regulator, ArsR family  54.1 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3335  transcriptional regulator, ArsR family  45.07 
 
 
110 aa  67  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  43.28 
 
 
104 aa  67  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  38.27 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  41.79 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3443  transcriptional regulator, ArsR family  40.62 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0208  transcriptional regulator, ArsR family  47.14 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  49.18 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0825  transcription regulator  41.18 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.692887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  42.67 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  43.08 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
348 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0833  arsenical resistance operon repressor  43.55 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0330276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1033  transcriptional regulator, ArsR family  41.33 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  46.27 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2405  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.673414  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3359  ArsR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
107 aa  64.7  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  37 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  43.06 
 
 
307 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3265  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  47.14 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  38.57 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0936  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 
103 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00366082  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 
312 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2426  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.575206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  45.31 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
106 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  44.93 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  42.86 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0423  regulatory protein, ArsR  40.51 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  42.86 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 
102 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 
337 aa  61.6  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2084  ArsR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
103 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3658  transcriptional regulator, ArsR family  44.62 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0215  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.45 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.807623 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4850  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.45 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
114 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3703  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.45 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2463  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.104943  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  42.37 
 
 
90 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03350  DNA-binding transcriptional repressor  45.45 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.449816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0213  transcriptional regulator, ArsR family  45.45 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  43.55 
 
 
101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03303  hypothetical protein  45.45 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.521109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  43.55 
 
 
101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3820  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.45 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
122 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3984  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.45 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3793  DNA-binding transcriptional repressor ArsR  45.45 
 
 
117 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.462226 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2549  ArsR family transcriptional regulator  48.48 
 
 
103 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.208067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  37.35 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  43.55 
 
 
101 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  44.29 
 
 
92 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  43.55 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  43.55 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  43.55 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  42.42 
 
 
349 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 
309 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2876  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.557946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  45.16 
 
 
101 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  35.37 
 
 
98 aa  60.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  43.55 
 
 
101 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3418  regulatory protein ArsR  40 
 
 
99 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799155  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  42.86 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  45.59 
 
 
115 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
101 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>