170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2402 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 		 276 aa  556  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  77.17 
 
 		 276 aa  439  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  63.41 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  62.63 
 
 		 289 aa  374  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  61.94 
 
 		 295 aa  371  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  41.51 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  39.57 
 
 		 279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  42.31 
 
 		 286 aa  208  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  43.08 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  42.21 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  40.68 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  39.05 
 
 		 291 aa  202  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  38.27 
 
 		 285 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  40.08 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  42.53 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  35.38 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  39.35 
 
 		 326 aa  193  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  36.43 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  41.98 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  36.59 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  38.55 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  41.38 
 
 		 297 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  35.88 
 
 		 283 aa  185  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  32.57 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  35.34 
 
 		 287 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0428  endonuclease IV  38.87 
 
 		 279 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  35.02 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  38.46 
 
 		 283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  39.54 
 
 		 282 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  37.14 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  36.33 
 
 		 280 aa  179  7e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  37.32 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  37.74 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  35.11 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  35.88 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  32.06 
 
 		 292 aa  175  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  36.26 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  38.35 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  37.12 
 
 		 282 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  41.13 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  34.64 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  36.33 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  36.2 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  38.21 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  39.77 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  37.86 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  35.91 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  33.59 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  36.4 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  35.14 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  32.44 
 
 		 287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1835  endonuclease IV  35.14 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  37.86 
 
 		 275 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  35.38 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  37.74 
 
 		 280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0245  endonuclease IV  34.98 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  35.11 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  35.27 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1487  endonuclease IV  35.52 
 
 		 283 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000253859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  34.96 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  36.92 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  36.84 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  36.84 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  35.36 
 
 		 289 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  33.94 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1670  endonuclease IV  35.14 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  36.84 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  36.84 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  36.84 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  33.97 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  36.84 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  36.84 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0134  apurinic endonuclease Apn1  34.73 
 
 		 280 aa  159  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0807  endonuclease IV  36.47 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  35.66 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  34.22 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  34.42 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  36.47 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  36.36 
 
 		 279 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1880  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1936  endonuclease IV  35.88 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.904759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  36.09 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2204  apurinic endonuclease Apn1  35.52 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  36.09 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  36.12 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2326  endonuclease IV  35.52 
 
 		 288 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  35.71 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  36.09 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3012  endonuclease IV  34.47 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00931491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00944  endonuclease IV  36.74 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3227  endonuclease IV  34.98 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  36.14 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  36.5 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004452  endonuclease IV  37.12 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.034826  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  36.17 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  34 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1939  endonuclease IV  36.36 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00102323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  33.97 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  35.71 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  40.54 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>