245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2398 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 
1004 aa  1994    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  59.38 
 
 
1221 aa  383  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  50.75 
 
 
1050 aa  361  4e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  69.77 
 
 
703 aa  336  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  68.99 
 
 
984 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  64.64 
 
 
748 aa  290  7e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  39.57 
 
 
626 aa  290  8e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  37.4 
 
 
651 aa  277  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  34.19 
 
 
768 aa  264  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2389  hypothetical protein  71.14 
 
 
507 aa  219  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  29.26 
 
 
717 aa  192  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  32.13 
 
 
481 aa  155  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  53.15 
 
 
611 aa  142  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  51.11 
 
 
831 aa  111  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.54 
 
 
845 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.65 
 
 
809 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  44.22 
 
 
870 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.57 
 
 
2170 aa  108  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  27.65 
 
 
1887 aa  108  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  43.54 
 
 
1356 aa  108  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  41.14 
 
 
823 aa  108  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.92 
 
 
819 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  37.5 
 
 
801 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  43.23 
 
 
719 aa  105  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 
840 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 
1234 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.57 
 
 
802 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  40.14 
 
 
1732 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  42.18 
 
 
1380 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.52 
 
 
729 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.61 
 
 
777 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  38.78 
 
 
524 aa  100  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  28.85 
 
 
1295 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  42.38 
 
 
1035 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  39.11 
 
 
762 aa  97.8  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  36.77 
 
 
798 aa  97.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  38.78 
 
 
2554 aa  97.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.97 
 
 
455 aa  97.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  32.47 
 
 
966 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40.94 
 
 
3295 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  31.41 
 
 
455 aa  96.3  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  32.84 
 
 
919 aa  95.9  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.05 
 
 
455 aa  95.5  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  36.69 
 
 
1132 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.52 
 
 
786 aa  95.5  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  42.18 
 
 
581 aa  95.1  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.65 
 
 
455 aa  94.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  32.01 
 
 
455 aa  94  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  32.3 
 
 
735 aa  94  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.32 
 
 
455 aa  94.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  30.32 
 
 
455 aa  94  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  36.17 
 
 
456 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.9 
 
 
933 aa  93.6  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  37.86 
 
 
630 aa  93.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  31.41 
 
 
455 aa  93.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.41 
 
 
455 aa  92.8  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.41 
 
 
455 aa  92.8  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  39.31 
 
 
500 aa  92.8  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  36.61 
 
 
459 aa  91.7  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  33.76 
 
 
458 aa  91.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  36.24 
 
 
1799 aa  91.3  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  37.24 
 
 
526 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  36.55 
 
 
458 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.33 
 
 
456 aa  90.9  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  32.2 
 
 
455 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  35.37 
 
 
468 aa  88.6  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  32.45 
 
 
930 aa  88.6  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  32.1 
 
 
918 aa  88.2  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.6 
 
 
1707 aa  88.2  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  38.62 
 
 
948 aa  87.8  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.58 
 
 
1387 aa  87  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  33.33 
 
 
1024 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  38.57 
 
 
982 aa  87  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  37.16 
 
 
522 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  35.03 
 
 
1262 aa  86.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  36.05 
 
 
954 aa  84.7  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  35.76 
 
 
627 aa  84.3  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  26.64 
 
 
930 aa  83.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  33.22 
 
 
938 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  35.37 
 
 
739 aa  82  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  34.97 
 
 
749 aa  81.3  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  32.19 
 
 
855 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  33.1 
 
 
550 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  26.69 
 
 
503 aa  80.5  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  30.19 
 
 
1167 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  30.8 
 
 
464 aa  80.1  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0594  Cellulase  25.09 
 
 
755 aa  80.1  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  30.33 
 
 
1238 aa  79  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.37 
 
 
1338 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  30.8 
 
 
875 aa  78.2  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.37 
 
 
1321 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  30.9 
 
 
465 aa  77.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  36.82 
 
 
484 aa  77.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.44 
 
 
743 aa  77.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  34.44 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  24.59 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  37.84 
 
 
973 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  37.82 
 
 
673 aa  73.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  25.82 
 
 
709 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  36.62 
 
 
569 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>