153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2388 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
768 aa  1548    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  44.24 
 
 
651 aa  413  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  37.41 
 
 
1221 aa  369  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  39.26 
 
 
703 aa  323  9.999999999999999e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  35.19 
 
 
1004 aa  263  8.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0302  glycoside hydrolase family 5  31.16 
 
 
481 aa  193  8e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0480106  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  46.24 
 
 
831 aa  189  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  27.4 
 
 
626 aa  181  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  54.64 
 
 
1050 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  23.73 
 
 
717 aa  137  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  71.95 
 
 
524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  64.13 
 
 
984 aa  105  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  50.67 
 
 
748 aa  101  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  42.35 
 
 
2170 aa  97.8  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  35.6 
 
 
1887 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  38.81 
 
 
743 aa  94  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  35.35 
 
 
458 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.85 
 
 
458 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.64 
 
 
729 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  41.85 
 
 
973 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  33.67 
 
 
455 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  33.67 
 
 
455 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  35.35 
 
 
455 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.67 
 
 
455 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.17 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  33.65 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32.83 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  33.84 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.65 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.17 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.33 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2397  PKD domain containing protein  48.28 
 
 
670 aa  84.3  0.000000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.861546  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.33 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  36.76 
 
 
2286 aa  84  0.000000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2390  Carbohydrate-binding family V/XII  43.93 
 
 
523 aa  83.2  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.254143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  33.33 
 
 
455 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2834  glycosyl hydrolase-like  31.4 
 
 
1238 aa  80.9  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00529602  normal  0.0523238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.78 
 
 
809 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.24 
 
 
464 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  36.9 
 
 
938 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  29.27 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  35.15 
 
 
762 aa  74.7  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  34.53 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  31.3 
 
 
465 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  33.76 
 
 
655 aa  71.2  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  49.38 
 
 
617 aa  70.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  29.96 
 
 
680 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  53.01 
 
 
1121 aa  69.7  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  35.18 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  39.88 
 
 
1017 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.32 
 
 
998 aa  66.6  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  30.62 
 
 
703 aa  67.4  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  42.27 
 
 
880 aa  66.6  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  44.12 
 
 
614 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  44.33 
 
 
552 aa  66.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.51 
 
 
1448 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  33.5 
 
 
900 aa  65.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  43.4 
 
 
1154 aa  65.5  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  30.94 
 
 
1160 aa  64.3  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  35.1 
 
 
1007 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  47.19 
 
 
1137 aa  63.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  29.68 
 
 
803 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.33 
 
 
6885 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  38.83 
 
 
674 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  32.09 
 
 
445 aa  62.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  47.19 
 
 
1209 aa  62.4  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  34.5 
 
 
997 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.64 
 
 
674 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  27.17 
 
 
454 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  44.58 
 
 
660 aa  60.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  32.54 
 
 
674 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  43.21 
 
 
544 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1236  fibronectin, type III  27.36 
 
 
235 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  40.91 
 
 
749 aa  59.7  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  34.13 
 
 
674 aa  60.1  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  35.92 
 
 
674 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.28 
 
 
795 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  38.22 
 
 
681 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  23.19 
 
 
347 aa  58.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  30.39 
 
 
598 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  34.44 
 
 
1462 aa  58.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  30.45 
 
 
854 aa  57.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1886  Cellulase  22.36 
 
 
451 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.271202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.75 
 
 
674 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.75 
 
 
674 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  31.75 
 
 
674 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.75 
 
 
674 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  22.3 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3239  cellulase  22.56 
 
 
638 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00277111  normal  0.266356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  32.97 
 
 
2334 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  30.83 
 
 
674 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  40.78 
 
 
649 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  42.48 
 
 
727 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  23.26 
 
 
709 aa  55.1  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  23.18 
 
 
1628 aa  55.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  23.71 
 
 
1167 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  42.71 
 
 
514 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2103  endoglucanase  24.88 
 
 
346 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  29.59 
 
 
448 aa  54.7  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  36.67 
 
 
787 aa  55.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>