101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2341 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2341  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 390 aa  752    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  56.38 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1346  major facilitator superfamily MFS_1  36.87 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0861  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.605059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3819  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 425 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000056973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  22.44 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  23.94 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  24.93 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.81 
 
 		 398 aa  53.9  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  27.64 
 
 		 446 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 425 aa  51.2  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8112  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 396 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.743041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  25.09 
 
 		 425 aa  49.7  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  22.08 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  29.87 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7075  major facilitator family transporter  25.43 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.240881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  29.17 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1028  MFS permease  33.7 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  23.5 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  24.22 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.95 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 440 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 398 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.82 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.08 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 574 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  24.28 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 515 aa  46.6  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  23.98 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1329  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0371  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  21.81 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  25.44 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5245  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5333  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.601093  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5624  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.87 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.598733  normal  0.403775 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  23.26 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.65 
 
 		 516 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.65 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 504 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1946  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.086986  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 444 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5607  drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  27.2 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864613  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4290  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700844  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4076  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  23.26 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3447  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.36 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 423 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3218  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  21.58 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 455 aa  43.9  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 432 aa  43.9  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  26.21 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 390 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.88 
 
 		 437 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 476 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 427 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 512 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1354  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 450 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 437 aa  43.1  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  22.1 
 
 		 449 aa  43.1  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  25.91 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  23.19 
 
 		 423 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 428 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>