More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2295 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  83.88 
 
 		 240 aa  415  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  86.9 
 
 		 240 aa  402  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  81.14 
 
 		 240 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  80.35 
 
 		 240 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  63.45 
 
 		 236 aa  319  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  58.4 
 
 		 237 aa  315  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  58.23 
 
 		 238 aa  304  8.000000000000001e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  59.17 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  59.41 
 
 		 240 aa  293  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  59.41 
 
 		 240 aa  291  6e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  59 
 
 		 240 aa  290  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  54.81 
 
 		 240 aa  287  8e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  57.56 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  54.62 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  53.75 
 
 		 240 aa  268  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  52.72 
 
 		 239 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  56.07 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  53.88 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  46.25 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  45.49 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  48.33 
 
 		 255 aa  209  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  49.8 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  49.38 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  48.13 
 
 		 246 aa  204  7e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  48.96 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  45.12 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  45.08 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  43.03 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  43.5 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  42.5 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  42.04 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  43.27 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  43.27 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  47.31 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  45.99 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  45.45 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  44.32 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1571  ribosomal protein L2  44.06 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000641133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  40.38 
 
 		 275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3755  ribosomal protein L2  41.71 
 
 		 278 aa  146  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  44.92 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  44.62 
 
 		 275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  45 
 
 		 279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  40.87 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0424  50S ribosomal protein L2  46.43 
 
 		 275 aa  144  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0891588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0197  50S ribosomal protein L2  41.83 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00345154  normal  0.0626583 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0984  50S ribosomal protein L2  42.47 
 
 		 280 aa  144  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10718  50S ribosomal protein L2  39.81 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0762488  normal  0.210258 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  42.93 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  44.32 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2562  50S ribosomal protein L2  46.51 
 
 		 287 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.244819  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  45.35 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  43.78 
 
 		 277 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0199  50S ribosomal protein L2  43 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0675116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0461  50S ribosomal protein L2  47.62 
 
 		 274 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  46.63 
 
 		 276 aa  141  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  46.63 
 
 		 276 aa  141  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2321  50S ribosomal protein L2  44.39 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000099496  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3432  ribosomal protein L2  43.45 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29710  LSU ribosomal protein L2P  44.31 
 
 		 279 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  44.02 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  46.96 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4318  ribosomal protein L2  43.71 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0934  50S ribosomal protein L2  44.31 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0813346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0956  50S ribosomal protein L2  42.49 
 
 		 274 aa  139  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00125176  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  41.06 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  41.06 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06280  50S ribosomal protein L2  45.24 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.396932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  42.77 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  43.17 
 
 		 273 aa  139  6e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  39.9 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0565  50S ribosomal protein L2  46.11 
 
 		 277 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  41.46 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  42.57 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2656  ribosomal protein L2  40.38 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  40.48 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  40.96 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  44.77 
 
 		 287 aa  136  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  42.42 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0630  ribosomal protein L2  42.51 
 
 		 278 aa  136  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>