41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2293 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2293  50S ribosomal protein L4P  100 
 
 
247 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1829  ribosomal protein L4/L1e  75.71 
 
 
247 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2448  50S ribosomal protein L4P  72.18 
 
 
248 aa  350  2e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0211  50S ribosomal protein L4P  70.4 
 
 
250 aa  345  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2219  50S ribosomal protein L4P  70.4 
 
 
250 aa  344  8.999999999999999e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0565  50S ribosomal protein L4P  57.38 
 
 
249 aa  259  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0002  50S ribosomal protein L4P  56.68 
 
 
253 aa  258  6e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0109  50S ribosomal protein L4P  57.61 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2252  50S ribosomal protein L4P  52.23 
 
 
249 aa  241  9e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000000213252  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0533  50S ribosomal protein L4P  49.6 
 
 
248 aa  238  5e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.434154  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0082  50S ribosomal protein L4P  51 
 
 
247 aa  232  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.182582 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0443  50S ribosomal protein L4P  49.2 
 
 
249 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1126  50S ribosomal protein L4P  51.39 
 
 
252 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0032  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 
252 aa  222  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.521177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0792  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 
252 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0126736  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0858  50S ribosomal protein L4P  50.6 
 
 
252 aa  219  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0806  50S ribosomal protein L4P  49 
 
 
252 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.288718  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0316  50S ribosomal protein L4P  47.04 
 
 
278 aa  214  8e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1727  50S ribosomal protein L4P  47.22 
 
 
251 aa  209  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1520  50S ribosomal protein L4P  45.38 
 
 
254 aa  194  8.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000105309  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1777  50S ribosomal protein L4P  43.65 
 
 
267 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0229  50S ribosomal protein L4P  44.44 
 
 
267 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2047  50S ribosomal protein L4P  44.22 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.758941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1584  50S ribosomal protein L4P  44.9 
 
 
285 aa  182  6e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0814  50S ribosomal protein L4P  44.22 
 
 
284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1797  50S ribosomal protein L4P  42.63 
 
 
281 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.300981  normal  0.693832 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0092  50S ribosomal protein L4P  40.24 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000165336  unclonable  0.000000383631 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0808  50S ribosomal protein L4P  39.04 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.493543 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74639  predicted protein  36.4 
 
 
363 aa  136  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.108089  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13310  predicted protein  34.62 
 
 
387 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.600406 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51018  predicted protein  31.87 
 
 
397 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322976  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01920  Ras2, putative  34.54 
 
 
363 aa  118  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.837276  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08176  60S ribosomal protein L4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03020)  34.17 
 
 
372 aa  105  9e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0814  50S ribosomal protein L4  25.26 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.0012008  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23031  50S ribosomal protein L4  27.95 
 
 
211 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0987  50S ribosomal protein L4  30.18 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114211  normal  0.0168487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1250  50S ribosomal protein L4  25.97 
 
 
207 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.919527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  28.4 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  28.4 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  26.24 
 
 
215 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0227  50S ribosomal protein L4  25.29 
 
 
211 aa  42  0.009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.102029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>